Classic QTL [Quantitative Trait Loci] scan using new genomic tools | Detección clásica de QTL [Quantitative Trait Loci] utilizando nuevas herramientas genómicas
2011
Fernández, A.I., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Alves, E., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Ramayo Caldas, Y., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Mercadé, A., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Noguera, J.L., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Silió, L., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Folch, J.M., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal | Rodríguez, C., Instituto Nacional de Investigación y Tecnología Agraria y Alimentaria, Madrid (España). Dept. de Mejora Genética Animal
Classic QTL scans have allowed to identify thousands of QTL for porcine economic important traits, despite the QTN identification has not been very successful. During the last years a great number of new genomic tools have been developed with the final aim of identifying the genetics variants regulating relevant traits. The aim of the present study was to carried out a new QTL scan for productive traits in the Iberian x Landrace experimental cross, using the genotyping information from the recently developed Porcine SNP60 Beadchip. First, linkage maps were built using the updated version of CRIMAP and the results showed mapping errors for several SNPs which should be taken into account in further analyses. A previous QTL scan with microsatellites allowed us to identify relevant QTL, however the new QTL scan carried out with high density marker maps in the present study has allowed us to identify new QTL in chromosomes poorly covered by the initial microsatellite scan, such as SSC1, SSC10 and SSC11.
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