Impacto nas acurácias dos valores genéticos para idade ao primeiro parto em diferentes cenários com paternidade incerta.
2017
TONUSSI, R. L. | SILVA, R. M. de O. | OLIVERI, B. F. | FEITOSA, F. L. B. | PERIPOLLI, E. | LEMOS, M. V. A. | BERTON, M. P. | PEREIRA, A. S. C. | LOBO, R. B. | BEZERRA, L. A. F. | MAGNABOSCO, C. de U. | AGUILAR, I. | DI CROCE, F. A. | BALDI REY, F. S.
Resumo: O objetivo deste estudo foi investigar o impacto nas acurácias de predição utilizando os métodos BLUP e ssGBLUP em diferentes cenários considerando paternidade incerta utilizando dados de uma população de bovinos Nelore. Foram estudados dados de 18.526 registros de idade ao primeiro parto (IPP). Os componentes de variância foram estimados usando os métodos BLUP e ssGBLUP. A matriz de parentesco (A) foi criada com diferentes proporções de animais com pais desconhecidos (0, 25, 50, 75 e 100%). Todos os modelos incluíram grupos contemporâneos como efeitos fixos. Os valores genéticos e genômicos (EBV / GEBV) foram avaliados em cada cenário para quatro grupos: ALL = todos os animais da população, BULL = somente touros com dez ou mais progênies; GEN = animais genotipados e YOUNG = animais jovens machos e fêmeas sem fenótipos. As acurácias de predição variaram de 0,04 a 0,17 e de 0,15 a 0,29 obtidas com o método BLUP e ssGBLUP, respectivamente. A variância genética aditiva manteve-se praticamente constante à medida que a proporção de reprodutores múltiplos aumentou na população, porém as acurácias de predição diminuíram de acordo com o aumento de reprodutores múltiplos independentemente do método utilizado (BLUP e ssGBLUP). O método ssGBLUP mostrou-se acurado em situações de incerteza paternidade, especialmente para a seleção de animais jovens. Abstract: The objective of this study was to investigate the impact on prediction accuracy using BLUP and ssGBLUP methods in different scenarios of uncertain paternity using data from a Nellore cattle population. Data from 18,526 records age at first calving (AFC) were studied. The variance components were estimated using BLUP and ssGBLUP methods. The relationship matrix (A) was created with different proportions of animals with unknown sires (0, 25, 50, 75, and 100%). All models included contemporary groups as fixed effects. The accuracy of the estimated breeding value (EBV/GEBV) was evaluated in each scenario with six groups of animals: ALL = all animals in the population, BULL = only bulls with ten or more progenies; GEN = genotyped animals and YOUNG = male and female young animals without phenotypes. Prediction accuracies ranged from 0.04 to 0.17 and from 0.15 to 0.29 obtained with BLUP and ssGBLUP method respectively. The additive genetic variance remained practically constant as the proportion of multiple sires increased in the population, however, the accuracies decreased according to the increase of multiple sires in the population using BLUP and ssGBLUP. The ssGBLUP method could be applied in situations of uncertainty paternity, especially for selection of young animals.
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