Le point sur la notion de connexion en génétique animale

The connectedness was defined through a statistical approach, and under the specific animal breeding situation, A good level of connectedness, ie a balanced distribution of the records across the levels of the genetic and environmental factors, is absolutely necessary for estimating and comparing the factors (herd effect, breeding values...) involved in a linear model of genetic evaluation, A criterion, varying continuously from 0 (complete disconnection) to 1 (perfect connection), was used for measuring the level of connectedness. The estimations provided are only useful when their accuracy is sufficient, thus only if the number of records upon which they rely is large enough. A criterion, used for measuring such accuracy, is also presented. The properties of these criterions were presented in a single theoretical design, Such an approach was also used for illustrating the decrease in the selection scheme efficiency due to a lack of connectedness. In the context of a selection scheme, geographical and environmental factors are known to greatly influence the degree of connectedness, A lack of connectedness is not easy to be detected by the breeder. A specific study of the connectedness and of the reliability of the data is then necessary before performing a genetic evaluation. The main situations encountered in the selection schemes (disconnectedness, insufficient or good connectedness) and their consequences on the breeders' strategy are discussed.

La notion de connexion est présentée dans son contexte statistique d’origine, puis définie dans le cadre plus spécifique de la génétique animale. Une connexion satisfaisante, à savoir une répartition suffisamment équilibrée des performances dans les différents niveaux des facteurs de variation génétiques ou environnementaux, est indispensable pour pouvoir estimer et comparer les facteurs (effets "troupeau", valeurs génétiques ...) inclus dans un modèle d’évaluation génétique. Elle est mesurée à l’aide d’un critère dont les valeurs varient de façon continue entre 0 (absence de connexion) et 1 (équilibre optimal). Par ailleurs, si les estimations sont réalisables, elles doivent être suffisamment précises pour pouvoir être exploitées et donc s’appuyer sur un nombre de performances assez important. Un critère est aussi présenté pour mesurer cette précision. Ces deux critères sont utilisés à titre d’exemple dans le cadre d’un dispositif théorique. Une telle approche permet aussi d’illustrer la perte de progrès génétique qu’entraîne l’absence de connexion. Dans le contexte d’un schéma de sélection, les facteurs géographiques et temporels représentent des facteurs de risques quant à l’absence de connexion. Les difficultés de perception par le sélectionneur d’un défaut de connexion sont soulignées. Elles amènent à préconiser des études spécifiques de la connexion et de manière plus générale de la nature et de la représentativité des performances incluses dans une évaluation génétique. Enfin, les principaux cas de figure auxquels peuvent être confrontés les schémas de sélection (connexion absente, insuffisante ou satisfaisante) et la stratégie correspondante du sélectionneur sont discutés.