Rétroingénierie et amélioration d’un modèle de morphogenèse des graminées prairiales
2013
Guénolé, Pierre-Alexandre
SisFRT est un modèle stochastique, individu centré, simulant le développement des brins d’herbe (talles) dans les prairies. Il s’intéresse à la dynamique démographique des talles des différentes espèces, à leurs déplacements dans l’espace et à la morphogenèse de leurs principaux organes (feuilles, racines et rhizomes). Ce modèle a été implémenté en C++/CLI. Il est relativement peu documenté ce qui rendait une rétroingénierie logicielle nécessaire. C’est dans cette optique qu’une documentation Doxygen a été créée.Une suite logique de ce travail a été de mettre en place des tests unitaires et des traces (logs) afin de détecter et corriger les fuites d’azote qui se manifestaient au cours des simulations. Des diagrammes UML, utilisés en complément, ont permis de faciliter cette tâche.Au final un outil permettant le suivi de l’azote à chaque jour de la simulation a été développé dans SisFRT. Les données qu’il produit peuvent être exportées au format csv. Les fuites d’azote ont été corrigées et la fonction d’acquisition d’azote par les racines a été entièrement repensée (conception) et réécrite (implémentation).
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