Divergence of olfactory receptors associated with the evolution of assortative mating and reproductive isolation in mice
2022
Smadja, Carole, M | Loire, Etienne | Caminade, Pierre | Severac, Dany | Gautier, Mathieu | Ganem, Guila | Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (UMR ASTRE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | BioCampus (BCM) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM) | Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX) ; Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-BioCampus (BCM) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [France-Sud])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | This work was supported by the European Union’s Seventh Framework Programme [FP7/2007-2013] –Marie Curie European Reintegration Grant (ERG), under Grant agreement n° PERG06-GA-2009-251008, as well as from the Agence Nationale pour la Recherche (ANR) under Grant agreement n° ANR-10-BLAN-1714ASSORTMATE. | ANR-10-BLAN-1714,ASSORTMATE,Spéciation adaptative: approche intégrative chez la souris.(2010) | European Project: 251008,EC:FP7:PEOPLE,FP7-PEOPLE-2009-RG,SPECIATIONGENOMICS(2011)
This version of the article has been peer-reviewed and recommended by Peer Community in Evolutionary Biology (https://peercommunityjournal.org/item/10.24072/pcjournal.190.pdf).Raw mapping files (BAM files) and metadata have been uploaded to the Short Read Archive (SRA, NCBI) under the bioproject ID PRJNA603262 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA603262/).Custom scripts produced for data analysis are deposited in Zenodo (https://doi.org/10.5281/zenodo.7225771).
اظهر المزيد [+] اقل [-]إنجليزي. Deciphering the genetic bases of behavioural traits is essential to understanding how they evolve and contribute to adaptation and biological diversification, but it remains a substantial challenge, especially for behavioural traits with polygenic architectures. In this study, we developed a population genomics approach coupled with functional predictions to address the evolution and genetic basis of olfactory-based assortative mate preferences in the house mouse, suspected tohave evolved as a response to selection against hybridisation. We used whole genome resequencing data and the C2 statistic of the program BAYPASS, which contrasts allele frequencies corrected for population structure, to characterize genetic differentiation between sets of populations with strong contrast in behaviour (expressing or not assortative mate preferences) and we identified some regions of the genome showing the expected significant and consistentassociation with behavioural divergence. A series of Olfactory and Vomeronasal Receptor genes, among the most differentiated genomic regions and in line with functional predictions, stand out as the prime candidates underlying this olfactory-based behavioural divergence. These genes form large gene clusters in the genome, with two main candidate clusters extending up to 1.8 Mb. Variant analyses indicate a potential dual role of regulatory and protein-coding changes in theevolution of choosiness. This study shows that combining expectations on the genomic patterns of divergence with functional expectations represents a promising route to unravelling the genetic architecture of complex trait variation and provides novel insights into the role of olfactory and vomeronasal receptors in mammal adaptation and speciation.
اظهر المزيد [+] اقل [-]الكلمات المفتاحية الخاصة بالمكنز الزراعي (أجروفوك)
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