Srn024, un petit ARN impliqué dans l’adaptation du pathogène Streptococcus agalactiae à son environnement

session : ARN régulateurs

International audience

فرنسي. Introduction et objectifs : Streptococcus agalactiae est la première cause d’infections néonatales humaines et un pathogène opportuniste pour plusieurs hôtes. Afin de survivre et coloniser l’hôte, la bactérie s’adapte à son environnement en modulant l’expression de ses gènes. Les petits ARN (sRNA), impliqués dans cette régulation, peuvent eux-mêmes être régulés par les systèmes à deux composants (TCS). Chez S. agalactiae, quatre sRNA ont été identifiés par RNAseq : Srn015, Srn024, Srn070 et Srn085 [1]. Des prédictions bio-informatiques indiquent que ces sRNA, nommés csRNA, seraient régulés par le TCS CiaRH [2]. Les objectifs de ce travail sont de prouver le rôle de CiaRH dans l’expression de ces sRNA et d’identifier une cible de Srn024, afin de mieux comprendre les réseaux de régulation bactériens.Matériels et méthodes : Pour prouver l’appartenance de ces sRNA au régulon CiaR, leur expression a d’abord été quantifiée par fusions transcriptionnelles dans les souches NEM316WT, NEM316ΔciaRH et NEM316ΔciaRH::ciaRHin situ. La séquence promotrice TTTAAG-5N-TTTAAG de Srn024, qui semble indispensable à la régulation des sRNA par la protéine CiaR, a été mutée afin d’évaluer par fusion transcriptionnelle l’impact de ces mutations sur l’expression de Srn024.Des prédictions bio-informatiques ont été réalisées pour identifier les cibles potentielles de Srn024. La régulation traductionnelle des gènes cibles par Srn024 a été évaluée dans NEM316WT, NEM316Δsrn024 et NEM316Δsrn024::srn024 in situ à l’aide d’un plasmide de fusion traductionnelle construit au laboratoire.Résultats, discussion et conclusion : Les fusions transcriptionnelles ont permis de mettre en évidence une régulation positive des quatre sRNA par le TCS CiaRH. De plus, les mutations réalisées dans la séquence promotrice TTTAAG-5N-TTTAAG montrent que cette séquence est indispensable pour la régulation de Srn024 par CiaR. Les analyses bio-informatiques ont permis d’identifier l’ARNm Gbs1288 comme cible potentielle de Srn024 (-17,17 ∆g). La fusion traductionnelle a montré une régulation négative de cette cible par Srn024. Gbs1288 est une pullulanase produite en présence de pullulane et de glycogène dans la souche COH1. Cependant, cette protéine n’est pas exprimée en présence de glucose [3]. Ces résultats semblent indiquer que S. agalactiae s’adapte aux sources nutritives disponibles dans son environnement par le biais de Srn024.