Development and interlaboratory agreement of real-time PCR for HPV16 quantification in liquid-based cervical samples
2018
Guenat, David | Dalstein, Véronique | Mauny, Frédéric | Saunier, Maëlle | Briolat, Jenny | Clavel, Christine, E. | Riethmuller, Didier | Mougin, Christiane | Prétet, Jean-Luc | Carcinogénèse épithéliale : facteurs prédictifs et pronostiques - UFC (UR 3181) (CEF2P / CARCINO) ; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC) | Laboratoire d'Excellence : Lipoprotéines et Santé : prévention et Traitement des maladies Inflammatoires et du Cancer (LabEx LipSTIC) ; École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut Gustave Roussy (IGR)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy)-Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Bourgogne (UB)-Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)-Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL) ; UNICANCER-UNICANCER-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Fédération Francophone de la Cancérologie Digestive, FFCD-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Dijon ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Centre d'Investigation Clinique de Besançon (Inserm CIC 1431) ; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang [Bourgogne-Franche-Comté] (EFS BFC)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC) | Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon) | Pathologies Pulmonaires et Plasticité Cellulaire - UMR-S 1250 (P3CELL) ; Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Hôpital universitaire Robert Debré [Reims] (CHU Reims) | Laboratoire Chrono-environnement (UMR 6249) (LCE) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC) | ANR-11-LABX-0021,Lipstic,Lipoprotéines et santé : prévention et traitement des maladies inflammatoires non vasculaires et du cancer(2011)
International audience
اظهر المزيد [+] اقل [-]إنجليزي. High risk HPV infection is the necessary cause for the development of precancerous and cancerous lesions of the cervix. Among HPV, HPV16 represents the most carcinogenic type. Since the determination of HPV16 DNA load could be clinically useful, we assessed quantitative real-time PCR targeting E6HPV16 and albumin genes on two different platforms. Series of SiHa cells diluted in PreservCyt were used to assess repeatability and reproducibility of two in-house real-time PCR techniques run in two different laboratories to determine HPV16 load. Furthermore, 97 HPV16 positive cervical samples were evaluated to estimate inter-center variability using Bland-Alman plots. As a whole, both techniques presented coefficients of variation for HPV16 load measurement similar to those established for other virus quantification with commercial kits. Moreover, the two real-time PCR techniques showed a very good agreement for HPV16 load calculation. Finally, we emphasize that robust HPV16 DNA quantification requires normalization of viral load by the cell number.
اظهر المزيد [+] اقل [-]الكلمات المفتاحية الخاصة بالمكنز الزراعي (أجروفوك)
المعلومات البيبليوغرافية
تم تزويد هذا السجل من قبل Institut national de la recherche agronomique