Identification of a novel vitivirus from pineapple in Reunion Island
2022
Lett, Jean-Michel | Massé, Delphine | Filloux, Denis | Candresse, Thierry | Massart, Sébastien | Marais, Armelle | Verdin, Eric | Cassam, Nathalie | Fernandez, Emmanuel | Roumagnac, Philippe | Teycheney, Pierre-Yves | Lefeuvre, Pierre | Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Unité Ravageurs et agents pathogènes tropicaux (RAPT) ; Laboratoire de la santé des végétaux (LSV) ; Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES) | Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Biologie du fruit et pathologie (BFP) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Unité de recherche TERRA [Gembloux] ; Gembloux Agro-Bio Tech [Faculté universitaire des sciences agronomiques de Gembloux] ([FUSAGx]) ; Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège) | Unité de Pathologie Végétale (PV) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Conseil Régional de La Réunion, | Anses | CIRAD | European Project:
Research Square
اظهر المزيد [+] اقل [-]إنجليزي. We report the complete genome sequencing of a novel member of the genus Vitivirus in the family Betaflexiviridae (subfamily Trivirinae) infecting pineapple. The full genome of this virus was obtained from total RNAs extracted from pineapple leaf samples collected in Reunion Island, using a combination of high-throughput sequencing technologies. It is 6,757 nt long, excluding the poly(A) tail, and shares all the hallmarks of vitiviruses. Phylogenetic analyses performed on the replication-associated protein and capsid protein gene sequences unambiguously place this new virus, for which we propose the name “pineapple vitivirus A”, in the Vitivirus genus.
اظهر المزيد [+] اقل [-]المعلومات البيبليوغرافية
تم تزويد هذا السجل من قبل Institut national de la recherche agronomique