Réponses des communautés ichtyologiques aux pressions anthropiques locales dans un contexte de changement climatique

فرنسي. La mer Méditerranée abrite une biodiversité marine importante avec un fort taux d’endémisme (environ 25 % de espèces). Les poissons (Ostéichthyens, Chondrichthyens et Agnatha) sont représentés par 684 espèces dont 9,2 % sont endémiques. Outre le rôle nécessaire des poissons dans la dynamique trophique et les flux de matière et d’énergie au sein des écosystèmes marins, les sociétés humaines bénéficient également de nombreux services écosystémiques générés par les populations ichtyologiques (e.g., source de protéine, régulation au sein du réseau trophique, valeur esthétique et récréative générant d’importants revenus liés au tourisme et aux activités récréatives). Cependant, la biodiversité et, en particulier au niveau plus global, le fonctionnement des écosystèmes côtiers méditerranéens, sont parmi les plus touchés à l’échelle mondiale en raison de pressions anthropiques croissantes dont les impacts sont et seront amplifiés du fait des effets du changement climatique. Contrairement à la dynamique liée au changement global, les pressions anthropiques locales peuvent être identifiées et gérées plus facilement à l’échelle régionale. Pour cela, il est nécessaire de quantifier et d’évaluer précisément les impacts de ces pressions notamment sur la communauté ichtyologique. Dans ce travail les impacts sur la communauté ichtyologique de quatre pressions anthropiques, communes sur les littoraux méditerranéens, ont été étudiés dans la baie de Calvi en Corse (France) : les effluents de l’émissaire de la station d’épuration de la ville de Calvi, une ferme aquacole, les activités de pêche récréative et, enfin, de plongée sous-marine. Les résultats indiquent que les rejets de l’émissaire n’induisent pas de modification de l’assemblage ichtyologique malgré un enrichissement local de la colonne d’eau en nutriments. L’aquaculture de petite échelle de production étudiée, influence la communauté ichtyologique sauvage en provoquant l’agrégation d’espèces omnivores ou carnivores conduisant à une augmentation de l’abondance totale et de la richesse spécifique à proximité des cages. Bien que l’effet agrégatif des cages soit avéré, le rayon d’impact est très limité spatialement et l’agrégation observée reste minimale en comparaison à d’autres fermes aquacoles plus importantes. L’étude multi-approche menée sur la pêche récréative a permis de quantifier et de caractériser, pour la première fois, la population de pêcheurs locaux en Balagne et d’établir les caractéristiques de la pêche embarquée, majoritairement pratiquée en dans cette région. Ces informations révèlent que les pêcheurs embarqués récréatifs prélèvent annuellement 28 tonnes de poissons, soit l’équivalent de 55 % de la production totale des pêcheurs professionnels en Balagne. De plus, notre étude a permis de mettre en évidence qu’environ 50 % des captures ne respectent pas la taille minimale de capture autorisée. Enfin, le travail conduit sur la pratique de la plongée sous-marine a permis de quantifier, pour la première fois, l’activité sur l’ensemble de la baie de Calvi, avec plus de 25 000 plongeurs recensés sur l’année 2019. Cette pression se traduit notamment par une pression sur l’habitat des populations ichtyologiques avec, en moyenne, 1 contact par minute des plongeurs avec le substrat. Les résultats de notre étude révèlent, par ailleurs, que les plongeurs non-expérimentés sont ceux ayant le plus de contacts involontaires tandis que les plongeurs expérimentés et/ou photographes ont le plus de contacts volontaires. Afin de réduire l’impact des plongeurs sur l’habitat, une mesure de sensibilisation des plongeurs sur les effets des contacts répétés des plongeurs sur l’habitat rocheux a été mise en place et testée. Il en ressort que les plongeurs ayant été sensibilisés avant la plongée ont significativement moins de contacts, que ce soit de type volontaire ou involontaire. Enfin, le dérangement des téléostéens par les plongeurs ne se traduit pas de la même manière en fonction de l’espèce considérée, ni en fonction de la taille au sein d’une même espèce. Bien qu’aucun changement majeur n’ait été relevé au niveau de l’abondance totale ou des indices de diversité, les abondances de trois espèces (Dentex dentex (Linnaeus, 1758), Epinephelus marginatus (Lowe, 1834) et Diplodus vulgaris (Geoffroy Saint Hilaire, 1817)) s’avèrent significativement réduites pendant/après le passage des plongeurs. De plus, le comportement du mérou brun (E. marginatus) face aux plongeurs a montré des variations en fonction de la taille de l’individu considéré avec un comportement de fuite marqué pour les individus de grande taille ( > 70 cm). Finalement, l’ensemble de ces résultats ont été discutés dans le contexte du changement global et particulièrement du changement climatique qui va induire une modification majeure des écosystèmes méditerranéens dans les décennies à venir. Cette thèse représente une avancée significative dans notre capacité à comprendre, prioriser et anticiper les impacts des pressions anthropiques locales sur les populations ichtyologiques côtières méditerranéennes et préconise des mesures de gestions qui devront être adaptatives en fonction des évolutions futures du changement global.

إنجليزي. The Mediterranean Sea is home to a significant marine biodiversity with a high rate of endemism (around 25% of species). The fish population (Osteichthyans, Chondrichthyans and Agnatha) is composed of 684 species, of which 9.2% are endemic. Beyond the fundamental role played by fish populations in the trophic dynamics and flows of matter and energy within marine ecosystems, they also provide human societies with many ecosystem services (e.g., source of protein, regulation of food web dynamics, aesthetic and recreational values generating important revenues from tourism and recreational activities). However, biodiversity and, particularly at a more global level, the functioning of coastal ecosystems, are deeply and increasingly affected by anthropic pressures, which are and will be amplified by the effects of climate change, particularly in the semi-closed Mediterranean Sea. In contrast with the complex dynamics of global change at a larger scale, local anthropogenic pressures can be identified and managed more easily at the regional scale. To do this, the quantification and evaluation of the consequences of these pressures are necessary, especially regarding the fish community. In this study, we assessed the impacts of four anthropogenic pressures common to the Mediterranean coasts on the ichthyological community present in the Bay of Calvi in Corsica (France). The anthropogenic pressures included effluents from the outfall of the Calvi wastewater treatment plant, an aquaculture farm, recreational fishing activities and scuba diving. The results indicated that the discharges from the outfall do not lead to any modification of the ichthyological assemblage despite a local enrichment of the water column in nutrients. The research also revealed that the small-scale production aquaculture influences the fish community by causing an aggregation of omnivorous or carnivorous species, leading to an increase in total abundance and species richness in the vicinity of the cages. Although the aggregative effect of the cages is demonstrated, the radius of impact is very limited in space and the observed aggregation remains minimal compared to other larger fish farms. The multi-approach study carried out on recreational fishing made it possible to quantify and characterise the population of local fisher in Balagne for the first time, as well as to establish the characteristics of boat fishing, which is predominantly practiced in this region. This assessment revealed that recreational boat fishers catch 28 tonnes of fish annually, equivalent to 55 % of the total production of professional fisher in Balagne. In addition, our study has shown that around 50 % of catches did not meet the minimum authorised in terms of mesh size. Finally, the study carried out on SCUBA diving enabled the first quantification of the activity in the entire Bay of Calvi, with more than 25,000 divers recorded in 2019. This pressure has specific impacts on fish populations’ habitat, with on average 1 contact per minute between divers and the substrate. The results of our study also showed that non-experienced divers are responsible for most of the involuntary contacts, while experienced divers and/or photographers are involved in most of the voluntary contacts. In order to reduce the impact of divers on fish habitat, we implemented and tested a measure to raise awareness about the effects of repeated diver contacts on rocky habitats. As a result, divers who benefitted from information to raise awareness about their impact before diving had significantly less voluntary and involuntary contacts while diving. Lastly, the disturbance of fish by divers did not have the same effects depending on the species considered or size, within the same species. Although there were no major changes in the total abundance or diversity index, the abundance of three species (Dentex dentex (Linnaeus, 1758), Epinephelus marginatus (Lowe, 1834) and Diplodus vulgaris (Geoffroy Saint Hilaire, 1817)) was found to be significantly reduced during/after the divers' passage. Furthermore, the behaviour of brown grouper (E. marginatus) towards divers showed variations based on the size of the individual considered, while noting a tendency to flee among larger individuals (> 70 cm). The above-mentioned results were discussed in the context of global change and particularly of climate change, which will induce a major evolution of Mediterranean ecosystems in the upcoming decades. This thesis shows the significant progress made in our ability to understand, prioritise and anticipate the impacts of local anthropogenic pressures on Mediterranean coastal fish populations. It further provides management recommendations that will need to be adapted to the human-environment dynamics in the context of global change.