Molecular characterisation and similarity relationships among iranian basil (Ocimum basilicum L.) accessions using inter simple sequence repeat markers Caracterização molecular de acessos de Ocimum basilicum L. por meio de marcadores ISSR

The study of genetic relationships is a prerequisite for plant breeding activities as well as for conservation of genetic resources. In the present study, genetic diversity among 50 Iranian basil (Ocimum basilicum L.) accessions was determined using inter simple sequence repeat (ISSR) markers. Thirty-eight alleles were generated at 12 ISSR loci. The number of alleles per locus ranged from 1 to 5 with an average of 3.17. The maximum number of alleles was observed at the A7, 818, 825 and 849 loci, and their size ranged from 300 to 2500 bp. A similarity matrix based on Jaccard's coefficient for all 50 basil accessions gave values from 1.00-0.60. The maximum similarity (1.00) was observed between the "Urmia" and "Shahr-e-Rey II" accessions as well as between the "Urmia" and "Qazvin II" accessions. The lowest similarity (0.60) was observed between the "Tuyserkan I" and "Gom II" accessions. The unweighted pair- group method using arithmetique average UPGMA clustering algorithm classified the studied accessions into three distinct groups. All of the basil accessions, with the exception of "Babol III", "Ahvaz II", "Yazd II" and "Ardebil I", were placed in groups I and II. Leaf colour was a specific characteristic that influenced the clustering of Iranian basil accessions. Because of this relationship, the results of the principal coordinate analysis (PCoA) approximately corresponded to those obtained through cluster analysis. Our results revealed that the geographical distribution of genotypes could not be used as a basis for crossing parents to obtain high heterosis, and therefore, it must be carried out by genetic studies.<br>O estudo das relações genéticas é um pré-requisito para atividades em reprodução de plantas assim como para conservação de recursos genéticos. Neste trabalho a diversidade genética entre 50 acessos de Manejericão Iraniano (Ocimum basilicum L.) foram determinadas usando marcadores de Seqüência Simples Repetida Interna (ISSR). Trinta e oito alelos foram identificados utilizando-se 12 locos ISSR. O número de alelos por lócus variou de 1 a 5 com uma média de 3,17. O máximo número de alelos foi observado em A7; 818; 825 e 849 locos, e seus tamanhos variaram de 300 a 2500 bp. Uma matriz de similaridade baseada no coeficiente de Jaccard para todas as 50 acessos obteve valores de 1,00-0,60. A máxima similaridade (1.00) foi observada nos acessos "Urmia" e "Shahr-e-Rey II" assim como entre os acessos "Urmia" e "Qazvin II". A menor similaridade (0,60) foi observada entre os acessos "Tuyserkan I" e "Gom II". O algoritmo de análise de agrupamentos foi o método da distância média usando a média aritmética (UPGMA) que classificou os acessos estudadas em três distintos grupos. Todos os acessos do manjericão com exceção de "Babol III", "Ahvaz II", "Yazd II" e "Ardebil I", foram localizadas nos grupos I e II. A cor da folha foi uma característica específica que influenciou o agrupamento dos acessos do Manjericão Iraniano. Devido a esta relação, os resultados da análise de coordenada principal (PCoA) aproximadamente corresponde à aquela obtida pela análise de agrupamentos. Os resultados revelam que a distribuição geográfica dos genótipos não pode ser usada como base para parentais cruzados com alta heterosis e, portanto devem ser conduzidos estudos genéticos para tais fins.