Detecção e caracterização do microbioma da conjuntiva ocular de cães sem afecções oftalmológicas

A conjuntiva ocular desempenha um papel importante na função lacrimal, na proteção imunológica do olho, nos movimentos oculares e na regeneração corneana, agindo como uma barreira à entrada de microrganismos. Infecções conjuntivais em cães são comuns e resultam tanto da invasão de microrganismos patogênicos, quanto do crescimento descontrolado da microbiota previamente existente. O presente estudo analisou a comunidade microbiana presente na conjuntiva ocular de uma população heterogênea de cães sem afecções oftalmológicas por meio de técnicas de Sequenciamento de Última Geração (NGS). Suabes conjuntivais foram coletados de ambos os olhos de 30 cães que, após o processamento, foram submetidos ao sequenciamento metagenômico através da plataforma Illumina. Foi identificada a predominância do filo Proteobacteria e dos gêneros Ralstonia e Burkholderia, além de uma minoria de fungos, enquanto vírus não foram encontrados. Por meio de sequenciamento de DNA microbiano total, o presente estudo trouxe novos dados a respeito deste tema, demonstrando a presença de organismos não-cultiváveis e previamente desconhecidos como parte do ambiente ocular. Como a conjuntivite é uma afecção comum que afeta o bem-estar e a qualidade de vida dos cães, portanto, é importante conhecer a microbiota conjuntival para entender os processos infecciosos que afetam este sítio e assim direcionar os tratamentos empregados de forma racional.

The conjunctiva plays essential role in the lacrimal function, immune protection of the eye, eye mobility and corneal regeneration, acting as a barrier to the entry of microorganisms. Conjunctival infections are common in dogs and result from both the invasion of pathogenic microorganisms and the uncontrolled growth of the existing microbiota. The present study analyzed the microbial community present on the ocular conjunctivae of a heterogeneous dog population without ophthalmological disorders by New Generation Sequencing (NGS) techniques. Conjunctival swabs were collected from both eyes of 30 dogs, which after processing were subjected to NGS sequencing through the Illumina platform. A predominance of the phylum Proteobacteria and the genera Ralstonia and Burkholderia were identified along with a minority of fungi, while viruses were not found. Through total microbial DNA sequencing, the present study have brought new data on this subject showing the presence of non-cultivable organisms that were previously unknown as part of the ocular environment. As conjunctivitis is a common condition that affects welfare and life quality of dogs, so it is important to know the microbiota of the conjunctiva in order to understand the infectious processes that affect it and to direct the treatments employed rationally.