Isolation and characterization of microsatellite markers for the threatened African endemic tree species Pterocarpus erinaceus Poir.
2020
Johnson, Benziwa Nathalie | Quashie, Marie Luce Akossiwoa | Chaix, Gilles | Camus‐kulandaivelu, Letizia | Adjonou, Kossi | Segla, Kossi Novinyo | Kokutse, Adzo Dzifa | Ouinsavi, Christine | Bationo, Babou André | Rabiou, Habou | Kokou, Kouami | Vignes, Hélène | Université de Lomé [Togo] | Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad) | Université de Parakou = University of Parakou (UP) | Institut de l'Environnement et Recherches Agricoles [Ouagadougou] (INERA) ; Centre national de la recherche scientifique et technologique [Ouagadougou] (CNRST) | Université de Diffa | This research was financially supported by Sud Expert Plantes Développement Durable (SEP2D) program [AAP1-45], Agence Universitaire de la Francophonie (AUF) [DRAO-1448-2019-02], Programme d'Appui à la Lutte contre le Changement Climatique: PALCC –AMCC+ [DCI-ENV/2016/39289 Devis programme multi-annuel n°DCI-ENV-2017/387-416], Service de Coopération et d'Action Culturelle (SCAC) and Campus France, CIRAD for the “Actions Incitatives-Soutien aux doctorants” Program, and genotyping platform of Agap unit managed by Pierre Mournet.
DATA ACCESSIBILITY: The data have been deposited with links to BioProject accession number PRJNA604893 in the NCBI BioProject database (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/). 17 Primers designed and evaluated: end of text (Table 4).
اظهر المزيد [+] اقل [-]International audience
اظهر المزيد [+] اقل [-]إنجليزي. To study the genetic diversity and structure of the forest species Pterocarpus erinaceus Poir., seventeen polymorphic nuclear microsatellite markers were isolated and characterized, using next-generation sequencing. Three hundred and sixty-five (365) individuals were analyzed within fifteen (15) West African populations. The number of alleles for these loci varied from 4 to 30, and the heterozygosity varied from 0.23 to 0.82. The seventeen (17) primers designed here will allow characterizing the genetic diversity of this threaten species on its natural stands and to better understand the population differentiation mechanisms shaping it.
اظهر المزيد [+] اقل [-]الكلمات المفتاحية الخاصة بالمكنز الزراعي (أجروفوك)
المعلومات البيبليوغرافية
تم تزويد هذا السجل من قبل Institut national de la recherche agronomique