HARNESSING PROBIOTICS AGAINST SALMONELLA HEIDELBERG AND GUT HEALTH ENHANCEMENT IN BROILERS USING OMICS TECHNIQUES | Utilisation des probiotiques pour combattre Salmonella Heidelberg et optimiser la santé intestinale des poulets de chair sur la base d'une analyse omique

إنجليزي. Salmonella Heidelberg is a significant foodborne pathogen that poses a serious threat to human health and necessitates extensive control measures and resources within the poultry meat production industry. Given the rise of antibiotic resistance in both livestock and humans and the established benefits of probiotics for intestinal health in broilers, this study evaluates the efficacy of new probiotic strains in combating Salmonella Heidelberg both in vitro and in vivo, as well as their potential to enhance intestinal health in broilers. The first chapter offers a literature review on Salmonella Heidelberg infections in chickens and the ability of Lactic Acid Bacteria (LAB), Saccharomyces boulardii (SB), and Bacillus velezensis to control Salmonella and regulate microbiota and metabolites in the poultry intestine. The second chapter investigates the inhibitory capabilities of various LAB and Saccharomyces boulardii (SB) strains in preventing Salmonella Heidelberg growth, both in vitro and in challenged broilers. This chapter also explores the relationship between probiotic supplementation and fecal metabolites, along with the composition of the cecal microbiome. The third chapter examines the inhibitory effects of Bacillus velezensis on Salmonella Heidelberg in poultry, providing a comprehensive analysis of the metabolomic and metagenomic profiles of individuals treated with Bacillus velezensis during infection challenges. The application of omics techniques, including metagenomics and metabolomics, in this study demonstrated that probiotics such as BV, LAB, and SB can significantly alter gut microbiota composition and fecal metabolite profiles in broilers, thereby inhibiting Salmonella Heidelberg colonization and improving gut health by reducing oxidative stress and intestinal inflammation.

فرنسي. Salmonella Heidelberg est un pathogène alimentaire majeur qui constitue une menace sérieuse pour la santé humaine et nécessite des mesures de contrôle rigoureuses ainsi que d'importantes ressources dans l'industrie de la production de viande de volaille. Face à l'augmentation de la résistance aux antibiotiques chez les animaux d'élevage et les humains, ainsi qu'aux bienfaits établis des probiotiques pour la santé intestinale des poulets de chair, cette étude évalue l'efficacité de nouvelles souches probiotiques pour combattre Salmonella Heidelberg, à la fois in vitro et in vivo, et leur potentiel à améliorer la santé intestinale des poulets de chair. Le premier chapitre propose une revue de la littérature sur les infections à Salmonella Heidelberg chez les poulets et la capacité des bactéries lactiques (LAB), de Saccharomyces boulardii (SB) et de Bacillus velezensis à contrôler Salmonella et à réguler le microbiote ainsi que les métabolites dans l'intestin des volailles. Le deuxième chapitre examine les capacités inhibitrices de diverses souches de bactéries lactiques et de Saccharomyces boulardii pour prévenir la croissance de Salmonella Heidelberg, à la fois in vitro et chez des poulets soumis à des défis infectieux. Ce chapitre explore également la relation entre la supplémentation en probiotiques et les métabolites fécaux, ainsi que la composition du microbiote caecal. Le troisième chapitre analyse les effets inhibiteurs de Bacillus velezensis sur Salmonella Heidelberg chez les volailles, en fournissant une analyse complète des profils métabolomiques et métagénomiques des individus traités avec Bacillus velezensis lors des défis infectieux. L'application des techniques omiques, notamment la métagénomique et la métabolomique, dans cette étude a montré que les probiotiques tels que BV, LAB et SB peuvent modifier significativement la composition du microbiote intestinal et des profils de métabolites fécaux chez les poulets de chair, inhibant ainsi la colonisation de Salmonella Heidelberg et améliorant la santé intestinale en réduisant le stress oxydatif et l'inflammation intestinale.

البرتغالية. Salmonella Heidelberg é um patógeno de origem alimentar que representa uma séria ameaça à saúde humana e requer extensas medidas de controle e recursos dentro da indústria de produção de carne de aves. Dado o aumento da resistência aos antibióticos tanto em animais de criação quanto em humanos e os benefícios comprovados dos probióticos para a saúde intestinal em frangos de corte, este estudo avalia a eficácia de novas cepas probióticas no combate à Salmonella Heidelberg, tanto in vitro quanto in vivo, bem como seu potencial para melhorar a saúde intestinal em frangos de corte. O primeiro capítulo oferece uma revisão de literatura sobre infecções por Salmonella Heidelberg em frangos e a capacidade de bactérias ácido-lácticas (BAL), Saccharomyces boulardii (SB) e Bacillus velezensis de controlar Salmonella, regular a microbiota e os metabólitos no intestino de aves. O segundo capítulo investiga as capacidades inibitórias de várias cepas de BAL e Saccharomyces boulardii (SB) na prevenção do crescimento de Salmonella Heidelberg, tanto in vitro quanto em frangos desafiados. Este capítulo também explora a relação entre a suplementação de probióticos e os metabólitos fecais, juntamente com a composição do microbioma cecal através de técnicas ômicas, como metabolômica e metagenômica. O terceiro capítulo examina os efeitos inibitórios de Bacillus velezensis sobre Salmonella Heidelberg em aves, fornecendo uma análise abrangente dos perfis metabolômicos e metagenômicos de indivíduos tratados com Bacillus velezensis durante desafios de infecção. A aplicação de técnicas ômicas, incluindo metagenômica e metabolômica, neste estudo demonstrou que probióticos como BV, BAL e SB podem alterar significativamente a composição da microbiota intestinal e os perfis de metabólitos fecais em frangos de corte, inibindo assim a colonização da Salmonella Heidelberg e melhorando a saúde intestinal ao reduzir o estresse oxidativo e a inflamação intestinal.