Análisis de ADN para la identificación varietal de parras antiguas de Almería

Trabajo fin de máster presentado en la Universidad Complutense de Madrid, Máster en Biología Vegetal Aplicada.--2021-09-16

[ES] El Grupo Ecologista Mediterráneo (GEM) desarrolla el proyecto Biodiversidad Domesticada, en el que han explorado, localizado y recolectado muchas parras antiguas en la provincia de Almería. Este trabajo se enmarca en una colaboración entre el GEM y el ICVV para la caracterización molecular de ese material de gran valor. Se ha realizado un análisis genotípico con hasta 11 microsatélites de 86 muestras de 2021 y de 25 muestras de las 126 prospectadas en el año 2019, todas procedentes de Almería. En el análisis global de resultados se tuvieron en cuenta las 212 muestras prospectadas, y se llevó cabo la identificación genética de las muestras comparando los perfiles de microsatélites obtenidos bases de datos propias e internacionales (VIVC). En total, se consiguieron identificar 74 genotipos diferentes, donde destacaron por su frecuencia variedades como Beba, Ahmeur Bou Ahmeur, De Cilindro y Negra Rayada. También se identificaron plantas de Ohanes, variedad muy relevante en la provincia de Almería, o de Cayetana. Desde el punto de vista genético, lo más interesante fueron los 36 genotipos que no aparecieron en ninguna base de datos, destacando los 13 que aparecieron más de una vez, sugiriendo que son variedades de interés local debido a su propagación vegetativa. Empleando datos de 240 SNPs obtenidos anteriormente en el laboratorio, se identificaron pedigríes con alta fiabilidad para nueve de los genotipos encontrados, seis de ellos novedosos. Este trabajo ha permitido desvelar genotipos desconocidos en las bases de datos, en riesgo de desaparecer, posibilitando la conservación de estos recursos genéticos para el futuro en colecciones de variedades.

[EN] The Mediterranean Ecologist Group (GEM) develops the Domesticated Biodiversity project, in which they have explored, located and collected many ancient vines in the province of Almería. This work is part of a collaboration between the GEM and the ICVV for the molecular characterization of this highly valuable material. A genotypic analysis has been carried out with up to 11 microsatellites from 86 samples from 2021 and from 25 samples of the 126 prospected in 2019, all from Almería. In the global analysis of results, the 212 prospected samples were taken into account, and the genetic identification of the samples was carried out by comparing the microsatellite profiles obtained from own and international databases (VIVC). In total, 74 different genotypes were identified, where varieties such as Beba, Ahmeur Bou Ahmeur, De Cilindro and Negra Rayada stood out for their frequency. Ohanes plants were also identified, a very relevant variety in the province of Almería, or Cayetana. From the genetic point of view, the most interesting were the 36 genotypes that did not appear in any database, highlighting the 13 that appeared more than once, suggesting that they are varieties of local interest due to their vegetative propagation. Using data from 240 SNPs previously obtained in the laboratory, pedigrees with high reliability were identified for nine of the genotypes found, six of them novel. This work has made it possible to reveal unknown genotypes in the databases, at risk of disappearing, making it possible to conserve these genetic resources for the future in collections of varieties.