The diversity of lipopeptides in the Pseudomonas syringae complex parallels phylogeny and sheds light on structural diversification during evolutionary history
2022
Bricout, Alexandre | Morris, Cindy E. | Chandeysson, Charlotte | Duban, Matthieu | Boistel, Corinne | Chataigné, Gabrielle | Lecouturier, Didier | Jacques, Philippe | Leclère, Valérie | Rochex, Alice | BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | Agence de l'Environnement et de la Maîtrise de l'Énergie (ADEME) | Unité de Pathologie Végétale (PV) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | BioEcoAgro - Equipe 4 - Secondary metabolites of microbial origin ; BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | BioEcoAgro - Equipe 7 - Health benefit of protein hydrolysates and agro-food co-products: control of production, characterization and valorisation ; BioEcoAgro - UMR transfrontalière INRAe - UMRT1158 ; Université d'Artois (UA)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL)-Université d'Artois (UA)-Université de Liège = University of Liège = Universiteit van Luik = Universität Lüttich (ULiège)-Université de Picardie Jules Verne (UPJV)-Université du Littoral Côte d'Opale (ULCO)-Université de Lille-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-JUNIA (JUNIA) ; Université catholique de Lille (UCL)-Université catholique de Lille (UCL) | Office Français de la Biodiversité (OFB) as part of the LIPOCONTROLE project of the APR “PSPE 2,” Ecophyto, Ministère de l’agriculture et l’alimentation | Agence de la transition écologique (ADEME) | Université de Lille (doctoral fellowship to Alexandre Bricout) | Alibiotech project, which is financed by European Union, French State, and the French Region of Hauts-de-France | European INTERREG France-Wallonie-Vlaanderen Va SmartBioControl/BioScreen project and received financial support from FEDER | FEDER | American Society for Microbiology | ANR-11-EQPX-0037,REALCAT,Plateforme intégREe AppLiquée au criblage haut débit de CATalyseurs pour les bioraffineries(2011)
International audience
اظهر المزيد [+] اقل [-]إنجليزي. Pseudomonas spp. colonize diverse aquatic and terrestrial habitats and produce a wide variety of secondary metabolites, including lipopeptides. However, previous studies have often examined a limited number of lipopeptide-producing strains. In this study, we performed a systematic analysis of lipopeptide production across a wide data set of strains of the Pseudomonas syringae complex (724) by using a combined bioinformatics, mass spectrometry, and phylogenetics approach. The large P. syringae complex, which is composed of 13 phylogroups, is known to produce factins (including syringafactin-like lipopeptides), mycins (including syringomycin-like lipopeptides), and peptins (such as syringopeptins). We found that 80.8% of P. syringae strains produced lipopeptides and that factins were the most frequently produced (by 96% of the producing strains). P. syringae strains were either factin monoproducers or factin, mycin, and peptin coproducers or lipopeptide nonproducers in relation to their phylogenetic group. Our analyses led to the discovery of 42 new lipopeptides, bringing the number of lipopeptides identified in the P. syringae complex to 75. We also highlighted that factins have high structural resemblance and are widely distributed among the P. syringae complex, while mycins and peptins are highly structurally diverse and patchily distributed.
اظهر المزيد [+] اقل [-]الكلمات المفتاحية الخاصة بالمكنز الزراعي (أجروفوك)
المعلومات البيبليوغرافية
تم تزويد هذا السجل من قبل Institut national de la recherche agronomique