RAPD and ITS reveal molecular variation of Chilean populations of Beauveria bassiana | RAPD e ITS detectan variación molecular en poblaciones Chilenas de Beauveria bassiana

Entomopathogenic fungi are an attractive alternative for the biological control of insects. In Chile, the Quilamapu Regional Research Center of the National Agricultural Research Institute (INIA) has collected about 400 isolates of the genus Beauveria along the country. A partial classification of this collection has been based on morphology and efficiency as biological control agents. It is necessary to complement this characterization with genetic molecular markers, to determine the level of genetic diversity in Chilean Beauveria bassiana populations and to identify banding patterns that discriminate among isolates from a representative sample of the B. bassiana collection. The analysis was done using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) and Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) of Internal Transcribed Spacer (ITS)-rDNA sequences. The RAPD analysis indicated high genetic diversity among the isolates, with a 43% of similarity on the average. RAPD were more efficient at identifying isolates. On the other hand, the ITS analysis determined a lower diversity, with an 83% of similarity among the isolates. The low number of haplotypes did not allow discrimination among isolates. ITS 1 region showed a higher number of restriction sites, compared to ITS 2 region. For the two molecular markers, genetic diversity was not associated with the geographical origin of the isolates.

Los hongos entomopatógenos son una alternativa atractiva para el control biológico de insectos plagas. En Chile, el Instituto de Investigaciones Agropecuarias (INIA), Centro Regional de Investigación Quilamapu mantiene aproximadamente 400 aislamientos de Beauveria, colectados a través del país. Esta colección ha sido parcialmente clasificada en base a su morfología y a su eficacia como controlador biológico. Sin embargo, es necesario complementar estos estudios con una caracterización a nivel genético-molecular, para determinar el nivel de diversidad genética de Beauveria bassiana e identificar posibles patrones de bandas que permitan dicriminar entre aislamientos. En este estudio, se analizaron 36 aislamientos de B. bassiana provenientes de diversas regiones geográficas del país. El análisis genético se realizó mediante el ADN Polimórfico Amplificado al Azar (RAPD) y la Reacción en Cadena de la Polimerasa-Fragmentos de Restricción Polimórficos (PCR-RFLP) de los espaciadores internos transcritos (ITS) de las secuencias ribosomales del ADN (ITS-rDNA). El análisis de RAPD indicó una alta diversidad genética entre los aislamientos, con un promedio de 43% de similitud. Por otro lado, el análisis de los ITS determinó una menor diversidad, con un 83% de similitud entre aislamientos. La región ITS 1 mostró un mayor número de sitios de restricción que la región ITS 2. Los RAPD fueron más eficientes para discriminar (o identificar) entre cepas debido al bajo número de haplotipos detectados con los ITS. Para los dos marcadores utilizados en este estudio, la diversidad genética no estuvo asociada con el origen geográfico de los aislamientos.