Sequencing of new bola-DRB3.2 alleles detected in mexican Creole cattle | Secuenciación de nuevos alelos bola-DRB3.2 detectados en ganado Criollo mexicano
2012
Félix Portillo, Monserrath | Ríos Ramírez, José Gonzalo | Erosa de la Vega, Gilberto Enrique | Rodríguez Almeida, Felipe
إنجليزي. The nucleic acid sequence of ten BoLA-DRB3.2 alleles detected by PCR-RFLP in Mexican Creole cattle was determined. The methodology used to determine such sequence was the SBT (sequence based typing). It was possible to determine that two alleles, correspond to DRB3*1602 and DRB3*1501 previously reported to the BoLA database. The remaining eight alleles had nucleic acid sequences different from those already published. When compared to the officially reported alleles, three of those defined in this study showed maximal homologies of 99 %, four had 98 % homology and one showed maximal identity of 94 %, therefore the conclusion was that those 8 alleles are unreported. The amino acid sequences deduced for these alleles showed differences from 2 to 51 % with respect to the officially published peptides. The sequence analysis of these new alleles supports the hypothesis that Mexican creole cattle possibly has a higher genetic potential to respond to a wider range of pathogen antigens than the other bovine races studied to date.
اظهر المزيد [+] اقل [-]الأسبانية؛ قشتالية. Se determinó la secuencia nucleotídica de diez alelos BoLA-DRB3.2 detectados por PCR-RFLP en ganado Criollo mexicano. La metodología utilizada para determinar dicha secuencia fue la SBT (sequence based typing). De los diez alelos analizados se logró determinar que dos correspondieron a los alelos DRB3*1602 y DRB3*1501 ya reportados en la base de datos BoLA. Los ocho restantes tuvieron secuencias nucleotídicas diferentes a las publicadas con anterioridad. Tres de los alelos definidos en este estudio mostraron homologías máximas del 99 % al compararse con los alelos oficialmente reportados, cuatro más tuvieron 98 % de homología y uno de ellos mostró una identidad máxima del 94 %. Se concluyó que estos ocho alelos no han sido reportados previamente. Las secuencias peptídicas deducidas para estos alelos mostraron diferencias en el rango del 2 hasta el 51 % con respecto a los péptidos publicados oficialmente. El análisis de la secuencia de estos nuevos alelos respalda la hipótesis de que el ganado Criollo mexicano posiblemente tiene mayor potencial genético para responder a una gama más amplia de antígenos patógenos, que las otras razas de bovino estudiadas hasta el momento.
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