"Códigos de barras de ADN de plantas en el noreste de México."
2023
Pérez Rodríguez, Miguel Ángel | Wei, Lihua | Robledo Torres, Valentín | Pacheco Reyes, Flor Cristina | Mendoza Villareal, Rosalinda
" Los códigos de barras de ADN (CBA) son secuencias cortas (400-800 pares de bases) de una región estandariza da del genoma de cualquier organismo. Los CBA ayudan a asignar, descubrir, caracterizar o distinguir especies. En plantas, los CBA más utilizados son los fragmentos rbcL (ribulosa-1,5-bisfosfato carboxilasa), matK (maturasa K) y los ITS2 (segundo espaciador transcrito interno). Debido a la necesidad de una identificación precisa de especies para su conservación y aprovechamiento existen iniciativas internacionales para codificar con CBA la biodiversi dad del mundo y, poner estos datos a disposición del público. En este proyecto se incrementa la disponibilidad de CBA de plantas de interés económico y ecológico del noreste mexicano. Se han determinado CBA de plantas de las familias Asparagaceae (77 secuencias de 19 especies), Fagaceae (82 secuencias de 19 especies), Cactaceae (90 secuencias de 17 especies). Se han determinado 74 secuencias matK, 89 rbcL y 86 ITS2, las cuales han sido publicadas en bases de datos internacionales de acceso público, como el NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/) donde hemos publicado 51 CBA de plantas o bien el Bold systems (https://www.boldsystems.org/) donde actual mente hemos publicado 173 CBA de plantas de nuestra región. Los análisis demostraron, en el caso de fagáceas, una agrupación consistente con el origen geográfico de las especies. El marcador con mayor poder discriminatorio cambia según el grupo taxonómico, por lo cual no puede haber un solo CBA universal. El proceso químico para la conservación de plantas en herbario afecta la eficiencia para obtener CBA y, esta afectación es diferente según el grupo taxonómico. Así mismo, hemos determinado CBA de plantas en una muestra de polen, lo cual nos permite determinar cuáles son las plantas que son ecológicamente relevantes para los polinizadores. Cabe mencionar que todas las secuencias generadas no existían previamente, por lo cual la información generada es nueva."
اظهر المزيد [+] اقل [-]"DNA barcodes (DNA barcodes) are short sequences (400-800 base pairs) of a standardized region of any organism's genome. DNA barcodes help assign, discover, characterize, or distinguish species. In plants, the most commonly used DNA barcodes are rbcL (ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase), matK (maturase K), and ITS2 (second internal transcribed spacer) fragments. Due to the need for accurate species identification for their conservation and use, there are international initiatives to code the world's biodiversity with DNA barcodes and make this data publicly available. This project increases the availability of DNA barcodes for plants of economic and ecological interest in northeastern Mexico. DNA barcodes have been determined for plants in the families Asparagaceae (77 sequences from 19 species), Fagaceae (82 sequences from 19 species), and Cactaceae (90 sequences from 17 species). A total of 74 matK, 89 rbcL, and 86 ITS2 sequences have been determined and published in international publicly accessible databases, such as NCBI (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/), where we have published 51 CBAs for plants, or Bold Systems (https://www.boldsystems.org/), where we have currently published 173 CBAs for plants from our region. The analyses demonstrated, in the case of Fagaceae, a grouping consistent with the geographic origin of the species. The marker with the greatest discriminatory power varies according to the taxonomic group, so there cannot be a single universal CBA. The chemical process for preserving plants in herbariums affects the efficiency of obtaining CBAs, and this impact varies according to the taxonomic group. Likewise, we determined the CBA of plants in a pollen sample, which allows us to determine which plants are ecologically relevant to pollinators. It is worth mentioning that all the sequences generated did not previously exist, so the information generated is new."
اظهر المزيد [+] اقل [-]الكلمات المفتاحية الخاصة بالمكنز الزراعي (أجروفوك)
المعلومات البيبليوغرافية
تم تزويد هذا السجل من قبل Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro