Pathogenesis of wildebeest-derived malignant catarrhal fever: lessons from micro-RNAs and the genome maintenance protein of alcelaphine herpesvirus 1

French. Chez les gammaherpèsvirus, le genre Macavirus regroupe des virus associés au coryza gangreneux (CG) et des virus phylogénétiquement proches. Le CG est caractérisé par une maladie lymphoproliférative aigue et fatale affectant de nombreux ruminants, dont le bovin. L’herpèsvirus alcélaphin 1 (AlHV-1) et l’herpèsvirus ovin 2 (OvHV-2) sont capables de persister à vie respectivement chez le gnou et le mouton, sans causer aucun signe clinique ni lésion. Lorsque ces virus sont transmis à d’autres ruminants sensibles, ceux-ci développent respectivement, la forme européenne (FECG) ou africaine du coryza gangreneux (FACG). L’impact économique de la FACG a été largement sous-estimé en Afrique sub-Saharienne ce qui traduit la nécessité de mieux comprendre les mécanismes à l’origine de la pathogénie de la FACG. Le développement de la FACG est étudié chez le lapin qui reproduit la maladie de manière comparable du point de vue macroscopique et histologique à ce qui a été décrit chez les bovins. Des études récentes ont montré que la FACG était associée à une sévère prolifération et infiltration de lymphocytes T CD8+ infectés latents dans la plupart des organes sans détection de particule virale infectieuse (Palmeira et al., 2013). De plus, la protéine de maintenance génomique (PMG) codée par l’ORF73 de l’AlHV-1 (aLANA), qui est responsable du maintien des épisomes viraux dans les cellules infectées, a été démontrée comme étant essentielle au développement de la FACG. Les ARNs non codants, comme par exemple les microARNs (miARNs), ainsi que les PMGs font partie des rares transcrits exprimés pendant la latence des gammaherpèsvirus. Les miARNs exprimés par les herpèsvirus jouent des rôles dans la régulation de la latence, la transformation tumorale des lymphocytes, le cycle cellulaire et l’immuno-évasion. Les PMGs sont responsables de la persistence épisomale dans les cellules infectées latentes au cours de la mitose tout en échappant à leur propre présentation, en contexte CMH-I, aux lymphocytes T cytotoxiques, un mécanisme nommé : immuno-évasion en cis. Ce travail reflète notre volonté de comprendre les mécanismes par lesquels l’AlHV-1 est capable de persister in vivo tout en restant indétectable par le système immunitaire. La première étude de cette thèse a été dédiée à l’identification des miARNs codés par l’AlHV-1 et de leurs rôles potentiels dans l’induction de la FACG. Nous avons identifié 36 miARNs potentiels dans des cellules infectées de veaux développant la FACG, parmi lesquels 32 étaient exprimés en deux groupes sur le brin complémentaire du génome. Après avoir validé l’expression de ces 32 miARNs, nous avons montré que la délétion du groupe comprenant 28 miARNs viraux n’affectait pas la croissance virale in vitro ni l’induction de la FACG chez les lapins. La deuxième étude traite de l’investigation de la propre inhibition, par aLANA, de sa présentation antigénique et du rôle potentiel de ce mécanisme dans le développement de la FACG avec l’aide du modèle lapin. Nous avons démontré que, tout comme ses orthologues, aLANA est capable d’inhiber sa propre présentation aux lymphocytes T cytotoxiques grâce à un mécanisme impliquant la diminution de sa propre synthèse protéique. Nous avons mis en évidence que la présence de la région riche en GE du domaine central répété de aLANA est responsable de ce mécanisme. Pour finir, nous avons généré une souche recombinante de l’AlHV-1 exprimant une protéine aLANA tronquée du domaine GE. Nous avons observé que l’absence de GE n’affectait pas la croissance virale in vitro et n’empêchait pas le développement de la FACG dans le modèle lapin. Ces résultats montrent que GE n’est pas essentiel pour la persistence virale ni la maintenance épisomale. Cependant, l’induction de la FACG a été significativement retardée chez 2 des 4 lapins infectés, ce qui suggère que la région GE de aLANA est potentiellement nécessaire à l’échappement de la réponse cytotoxique anti-virale pendant la FACG. Les macavirus sont capables de persister dans leur hôte naturel alors que la transmission du virus à d’autres espèces sensibles mène au développement de la FACG. Des études récentes ont placé la latence des gammaherpèsvirus au cœur de la pathogénie de la FACG. Il est intéressant de mieux comprendre le mécanisme par lequel l’AlHV-1 est capable de persister in vivo et d’induire la FACG tout en restant caché de la réponse immunitaire afin d’améliorer nos connaissances actuelles sur la pathogénie des macavirus, et plus généralement des gammaherpèsvirus.