Representing and encoding plant architecture: a review [geometry, topology, scales of representation]

French. Une plante est constituee d'entites ayant des types et des formes varies. L'organisation geometrique et topologique de ses entites definit "l'architecture de la plante". Avant le debut des annees 7O, la seule facon de representer l'architecture des plantes etait de faire des dessins botaniques precis. Dans les deux dernieres decennies, l'utilisation d'ordinateurs de plus en plus puissants a permis de concevoir des modeles de simulation de croissance de plante capables de produire des architectures detaillees et de les visualiser. Ceci a favorise l'emergence d'un ensemble varie de methodes de representation de l'architecture des plantes (chaines de caracteres, "axial trees", graphes arborescents, graphes multi-echelles, listes chainees, representations objet, matrices, fractales, ensemble de points digitalises, etc.). Dans cet article, on passe en revue les principales representations de l'architecture des plantes, en insistant sur leurs specificites, mais aussi sur leurs points communs. L'heterogeneite apparente de ces representations rend la collecte des informations decrivant l'architecture des plantes difficilement reutilisable. Toutefois, la mesure de "donnees architecturales" est un element d'une importance capitale dans la conception de modeles structure/fonction. C'est aussi une tache particulierement longue et fastidieuse. C'est pourquoi on suggere a l'issue de cette revue, qu'une action de premiere importance a mener dans la communaute de modelisation est de definir des formats de donnees et des outils communs pour creer des bases de donnees architecturales standard. Ces bases de donnees pourraient etre specifiees, recueillies et exploitees par differentes equipes de recherches, factorisant ainsi les efforts et se dotant des moyens de comparer leurs resultats sur des bases communes