Etude de la diversité allélique du gène S-RNase chez l'amandier
2009
Alaux , Ludovic (INRA (France). UR 1052 Génétique et Amélioration des Fruits et Légumes)
French. L’amandier (Prunus dulcis) possède un système d’auto-incompatibilité pollinique gamétophytique. Ce système est contrôlé par le locus S, multiallélique. Ce locus contient le gène S-RNase et le gène SFB. Le but de cette étude est de déterminer les allèles de la S-RNase présents dans la collection de ressources génétiques de l’amandier de l’INRA d’Avignon. Cette étude se déroule dans le cadre du programme européen SAFENUT. Nous avons utilisé des techniques de PCR pour détecter le polymorphisme de taille des introns du gène S-RNase et déterminer les allèles S. Ces génotypes ont été confirmés à l’aide d’amorces spécifiques d’allèles. Nous avons également séquencé les génotypes donnant des résultats différents des allèles déjà connus. Au cours de cette étude, nous avons génotypé 224 cultivars et trouvé plusieurs nouveaux allèles. Nous avons constaté que le gène S-RNase présente une diversité génétique importante. En effet, beaucoup d’allèles différents de ce gène existent et ceux-ci sont associés à des séquences ADN très variables.
Show more [+] Less [-]English. Almond (Prunus dulcis) has a gametophytic pollen self-incompatibility. This locus contains the S-RNase gene and the SFB gene. The aim of this study is to determine the alleles of the S-RNase gene in the Avignon INRA almond genetic resource collection. This study is in the SAFENUT project. We used PCR techniques to detect the size polymorphism of the S-RNase gene introns and determine S alleles. These genotypes are confirmed with allele-specific primers. We also sequenced the genotypes which results differed from known alleles. During this study, we genotyped 224 cultivars and found several new alleles. We noticed that the S-RNase gene has an important diversity. Indeed, a lot of different alleles of this gene exist, and these ones are associated with sequences very variable.
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