Genetic polymorphism of milk proteins in African Bos taurus and Bos indicus populations. Characterization of variants alpha s1-CnJ (Bos taurus, Bos indicus)

French. Caractérisation des variants αs1-Cn H et К-Cn J. Le polymorphisme des caséines, de l’α-lactalbumine et de la ß-lactoglobuline a été analysé dans des populations bovines africaines de type taurin (N’Dama, Baoulé, Kouri) et zébu (Choa, Peuhl). Les fréquences respectives des allèles αs1-CnB et αs1- CnC chez les taurins N’Dama (0,89 et 0,11) et Baoulé (0,92 et 0,08) tendent à être inverses de celles trouvées chez le zébu Choa, un zébu vrai (0,22 et 0,78), ce qui confirme un phénomène déjà signalé dans la littérature. L’haplotype αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB prédominant nettement chez ces taurins (0,56 et 0,60), par contraste à l’haplotype αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA chez le zébu Choa (0,63), l’inversion des fréquences entre taurins et zébus s’observe également aux loci ß-Cn and К-Cn. Ces résultats confirment que le groupe des gènes des caséines fait partie des marqueurs de choix pour discriminer entre des origines de type Bos taurus et Bos indicus. Le Kouri occupe une position intermédiaire puisque l’allèle αs1-CnB prédomine comme chez les taurins, alors que l’haplotype le plus fréquent est αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA comme chez les zébus. Ces particularités peuvent être interprétées comme révélant des pratiques de métissage plus ou moins anciennes avec des zébus. Inversement, mais à un bien moindre degré, le polymorphisme du zébu Peuhl révèle une influence taurine, en accord avec ce qui est admis sur les antécédents de ce type de bovin. Aucun polymorphisme de la caséine αs2 n’a pu être identifié, alors que l’α-lactalbumine est polymorphe dans toutes les populations. Deux variants supplémentaires, probablement spécifiques des populations africaines, ont été identifiés. Le variant H de la caséine αs1, trouvé chez le Kouri, se caractérise par la délétion de la séquence de huit résidus d’acides aminés (51-58) codée par l’exon 8,conséquence vraisemblable d’une anomalie d’épissage de l’ARN messager, l’allèle αs1-CnH dérivant de l’allèle αs1-CnB. Le variant J de la caséine К, trouvé chez le Baoulé, dérive du variant B par la substitution Ser 155 (B) -Arg (J). L’existence d’au moins un autre allèle de la caséine αs1 est suggérée. ( Formule document ci-joint)

English. The polymorphism of caseins, α-lactalbumin and ß-lactoglobulin was investigated in African Bos taurus (N’Dama, Baoulé, Kuri) and Bos indicus (Shuwa Arab, Sudanese Fulani) populations. The respective frequencies of alleles αs1-CnB and αs1-CnC in the N’Dama (0.89 and 0.11) and Baoulé (0.92 and 0.08) breeds were almost opposite to those found in the Shuwa Arab zebu (0.22 and 0.78), a true zebu, which confirms a phenomenon already documented in the literature. Because the αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB haplotype was strongly predominant in N’Dama and Baoulé (0.56 and 0.60), as compared to the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA haplotype in the Shuwa Arab zebu (0.63), an opposite trend in frequencies was also observed between taurines and zebus at the ß-Cn and К-Cn loci. These results confirm that the polymorphism of caseins provides an efficient marker system to discriminate Bos taurus from Bos indicus origins. The Kuri was at an intermediate position, since, in this population, the αs1-CnB allele predominated as in taurines, while the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA. The polymorphism of caseins, α-lactalbumin and ß-lactoglobulin was investigated in African Bos taurus (N’Dama, Baoulé, Kuri) and Bos indicus (Shuwa Arab, Sudanese Fulani) populations. The respective frequencies of alleles αs1-CnB and αs1-CnC in the N’Dama (0.89 and 0.11) and Baoulé (0.92 and 0.08) breeds were almost opposite to those found in the Shuwa Arab zebu (0.22 and 0.78), a true zebu, which confirms a phenomenon already documented in the literature. Because the αs1-CnB, ß-CnA1, К-CnB haplotype was strongly predominant in N’Dama and Baoulé (0.56 and 0.60), as compared to the αs1-CnC, ß-CnA2, К-CnA haplotype was the most frequent, as in zebus. This may be interpreted as revealing intercrossings with zebus in the previous history of this cattle type. Conversely, but to a lesser degree, the polymorphism of the Sudanese Fulani zebu indicates a taurine influence, in accordance with what is accepted about the origins of this cattle type. No polymorphism of αs2-casein could be identified, while α-lactalbumin was polymorphic in all populations. Two additional variants, probably specific to African cattle, were observed. Variant H of αs1-casein, found in kuri, is characterized by the deletion of the eight amino acid residues (51-58) coded by exon 8, a probable consequence of exon skipping. Allele αs1-CnH is derived from αs1-CnB. Variant J of К-casein, found in Baoulé, is derived from variant B by the substitution of Ser 155 (B) - Arg (J). The existence of at least another allele of αs1-casein was suggested. (see attached document)