Groupes microbiens fonctionnels : de la pré-identification (SIP) à l'observation in situ (NanoSIMS)
2007
Li, T. | Mazeas, L. | Toffin, L. | Wu, T.D. | Guerkin-Kern, J.L. | Bouchez, T.
French. Cet article décrit comment les méthodologies d'exploration fonctionnelle utilisant les isotopes stables (13C,15N,...) peuvent être couplés aux techniques de microbiologie moléculaire afin de comprendre le fonctionnement des flores microbiennes complexes de dépollution. Un travail réalisé au Cemagref-HBAN portant sur les flores microbiennes anaérobies de dégradation de la cellulose dans les digesteurs de déchets ménagers est pris en exemple afin d'illustrer la démarche. Dans ce cadre, les méthodologies SIP ("Stable Isotope Probing") ont été utilisées et une nouvelle méthode d'observation in situ des groupes microbiens responsables des réactions de dégradation a été développée (SIMISISH : Secondary Ion Mass Spectrometry In Situ Hybridization).
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