Using otolith microchemistry within Bayesian reallocation models to explore the Allis shad (Alosa alosa) metapopulation functioning

French. La grande alose, espèce anadrome répartie de la France au Portugal, a subi une importante contraction de son aire de répartition ainsi qu’un déclin généralisé. Peu d’études se sont jusqu’alors intéressées aux échanges entre les rivières où résident les grandes aloses. Pourtant, la connaissance des taux de retours sur rivières natales ainsi que les flux entre rivières permettraient de savoir si la gestion doit s’appliquer à l’échelle d’une métapopulation (i.e. sous-populations connectées), ou de populations isolées et indépendantes. Ce travail vise à étudier le fonctionnement de la métapopulation de grande alose à partir de l’utilisation de modèles de réassignation Bayésiens et de signatures microchimiques d’otolithes. Nous avons dans un premier temps développé et comparé différents modèles avant de sélectionner le plus crédible pour pouvoir établir un modèle d’échanges entre rivières et mettre en évidence les bassins versants à protéger en priorité. Nous avons développé 3 modèles : (1) un modèle basé sur l’inférence de la rivière natale à partir de données de référence (microchimie de l’eau et d’otolithes de juvéniles), (2) un modèle ne fixant pas le nombre de sources et n’intégrant pas de données de référence, (3) et un modèle hybride combinant les deux premières approches. En nous basant sur des critères statistiques et écologiques, nous avons finalement sélectionné le premier modèle. A partir du modèle d’échanges, nous avons montré un isolement par la distance. Le retour sur rivière natale et l’errance à l’échelle des bassins versants sont les deux stratégies privilégiées par les grandes aloses. Cependant des échanges à longues distances ont été mis en évidence. Nous avons donc conclu qu’il s’agissait d’un fonctionnement en métapopulation et que la gestion devrait privilégier la restauration des rivières sources. A l’avenir, l’étude de la dynamique spatio-temporelle de la métapopulation devrait permettre de comprendre si le changement climatique pourrait induire un replacement des populations d’aloses vers le nord.