Extended-spectrum b-lactamase-encoding genes are spreading on a wide range of Escherichia coli plasmids existing prior to the use of third-generation cephalosporins

Branger, Catherine | Ledda, Alice | Billard-Pomares, Typhaine | Doublet, Benoît | Fouteau, Stéphanie | Barbe, Valérie | Roche, David | Cruveiller, Stéphane | Médigue, Claudine | Castellanos, Miguel | Decré, Dominique | Drieux-Rouze, Laurence | Clermont, Olivier, O. | Glodt, Jérémy | Tenaillon, Olivier | Cloeckaert, Axel | Arlet, Guillaume | Denamur, Erick, E. | Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)) ; Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Department of Infectious Disease Epidemiology [London] (DIDE) ; Imperial College London | Service de Microbiologie Clinique [Hôpital Avicenne - APHP] ; Hôpital Avicenne [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP) | Infectiologie et Santé Publique (UMR ISP) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Tours (UT) | Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM) ; Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU) | This work was supported by a grant from the Agence Nationale de la Recherche (grant ANR-10-GENM-0012) to C. B. This work was also partially supported by a grant from the ‘Fondation pour la Recherche Médicale to E. D. (Equipe FRM 2016, grant number DEQ20161136698). | MicroScope Plateform | ANR-10-GENM-0012,RepliColScope,Séquençage et génomique comparative des plasmides de Escherichia coli : apport à la compréhension du succès évolutif des ß-lactamases à spectre étendu(2010)