The grapevine genome sequence suggests ancestral hexaploidization in major angiosperm phyla.
2007
Jaillon, Olivier | Aury, Jean-Marc | Noel, Benjamin | Policriti, Alberto | Clepet, Christian | Cassagrande, Alberto | Choisne, Nathalie | Aubourg, Sébastien | Vitulo, Nicola | Jubin, Claire | Vezzi, Alessandro | Legeai, Fabrice | Hugueney, Philippe | da Silva, Corinne | Horner, David | Mica, Erica | Jublot, Delphine | Poulain, Julie | Bruyère, Clémence | Billaut, Alain | Ségurens, Béatrice | Gouyvenoux, Michel | Ugarte, Edgardo | Cattorano, Federica | Anthouard, Véronique | Vico, Virginie | del Fabbro, Christian | Alaux, Michaël | Di Gaspero, Gabriele | Dumas, Vincent | Felice, Nicoletta | Paillard, Sophie | Juman, Irena | Moroldo, Marco | Scalabrin, Simone | Canaguier, Aurélie | Le Clainche, Isabelle | Malacrida, Giorgio | Durand, Eléonore | Pesole, Graziano | Laucou, Valérie | Chatelet, Philippe | Merdinoglu, Didier | Delledonne, Massimo | Pezzotti, Mario | Lecharny, Alain | Scarpelli, Claude | Artiguenave, François | Pé, M. Enrico | Valle, Giorgio | Morgante, Michele | Caboche, Michel | Adam-Blondon, Anne-Françoise | Weissenbach, Jean | Quétier, Francis | Wincker, Patrick | Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité (LBGB) ; Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Istituto di Genomica Applicata (IGA) | Dipartimento di Matematica e Informatica - Universita Udine (DIMI) ; Università degli Studi di Udine - University of Udine [Italie] | Unité de recherche en génomique végétale (URGV) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Dipartimento di Scienze Agrarie ed Ambientali - Universita Udine (DISA) ; Università degli Studi di Udine - University of Udine [Italie] | CRIBI (CRIBI) ; Università degli Studi di Padova = University of Padua (Unipd) | Unité de Recherche Génomique Info (URGI) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Santé de la vigne et qualité du vin (SVQV) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Strasbourg (UNISTRA) | Dipartimento di Scienze Biomolecolari e Biotecnologie ; Università degli Studi di Milano = University of Milan (UNIMI) | Dipartimento di Biochimica e Biologia Molecolare ; Università degli studi di Bari Aldo Moro = University of Bari Aldo Moro (UNIBA) | Istituto Tecnologie Biomediche ; National Research Council of Italy | Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR) | Diversité et génomes des plantes cultivées (UMR DGPC) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) | Développement et amélioration des plantes (UMR DAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Dipartimento Scientifico e Tecnologico (DST) ; Università degli studi di Verona = University of Verona (UNIVR) | Dipartimento di Scienze, Tecnologie e Mercati della Vite e del Vino ; Università degli studi di Verona = University of Verona (UNIVR) | VIGNA-CRA Initiative (VIGNA-CRA INITIATIVE) ; Consorzio Interuniversitario Nazionale per la Biologia Molecolare delle Piante
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Show more [+] Less [-]English. The analysis of the first plant genomes provided unexpected evidence for genome duplication events in species that had previously been considered as true diploids on the basis of their genetics. These polyploidization events may have had important consequences in plant evolution, in particular for species radiation and adaptation and for the modulation of functional capacities. Here we report a high-quality draft of the genome sequence of grapevine (Vitis vinifera) obtained from a highly homozygous genotype. The draft sequence of the grapevine genome is the fourth one produced so far for flowering plants, the second for a woody species and the first for a fruit crop (cultivated for both fruit and beverage). Grapevine was selected because of its important place in the cultural heritage of humanity beginning during the Neolithic period. Several large expansions of gene families with roles in aromatic features are observed. The grapevine genome has not undergone recent genome duplication, thus enabling the discovery of ancestral traits and features of the genetic organization of flowering plants. This analysis reveals the contribution of three ancestral genomes to the grapevine haploid content. This ancestral arrangement is common to many dicotyledonous plants but is absent from the genome of rice, which is a monocotyledon. Furthermore, we explain the chronology of previously described whole-genome duplication events in the evolution of flowering plants.
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Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Institut national de la recherche agronomique