Insights into the Planktothrix genus: Genomic and metabolic comparison of benthic and planktic strains
2017
Pancrace, Claire | Barny, Marie-Anne | Ueoka, Reiko | Calteau, Alexandra | Scalvenzi, Thibault | Pédron, Jacques | Barbe, Valérie | Piel, Joern | Humbert, Jean-François | Gugger, Muriel | Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Collection des Cyanobactéries ; Institut Pasteur [Paris] (IP) | Eidgenössische Technische Hochschule - Swiss Federal Institute of Technology [Zürich] (ETH Zürich) | Génomique métabolique (UMR 8030) ; Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Genoscope - Centre national de séquençage [Evry] (GENOSCOPE) ; Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA) | MicroScope Platform | ANR-15-CE34-0002,CYPHER,Rôle cellulaire de toxines de cyanobactéries et réponses aux stress environementaux(2015)
A utilisé MicroScope Platform
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Show more [+] Less [-]English. Planktothrix is a dominant cyanobacterial genus forming toxic blooms in temperate freshwater ecosystems. We sequenced the genome of planktic and non planktic Planktothrix strains to better represent this genus diversity and life style at the genomic level. Benthic and biphasic strains are rooting the Planktothrix phylogenetic tree and widely expand the pangenome of this genus. We further investigated in silico the genetic potential dedicated to gas vesicles production, nitrogen fixation as well as natural product synthesis and conducted complementary experimental tests by cell culture, microscopy and mass spectrometry. Significant differences for the investigated features could be evidenced between strains of different life styles.
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This bibliographic record has been provided by Institut national de la recherche agronomique
