Avis de l'Anses relatif au rôle épidémiologique éventuel de certaines espèces animales dans le maintien et la propagation du virus SARS-CoV-2

French. Le 31 décembre 2019, les autorités chinoises informent l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS) de cas groupés de pneumonies, en lien avec un marché de fruits de mer et d’animaux vivants dans la ville de Wuhan (région du Hubei), en Chine. Le virus émergent (2019-nCoV), un coronavirus officiellement désigné par l’OMS par « SARS-CoV-2 » (Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) le 11 février 2020, est responsable de la maladie COVID-19 (Coronavirus Disease, survenue en 2019).La voie principale de transmission du SARS-CoV-2 est interhumaine, par contact direct ou indirect ou par voie aérienne à travers l’inhalation de microgouttelettes émises lors d’éternuements ou de toux par le patient (Bernard Stoecklin et al. 2020). La transmission du virus peut également se produire à partir d’aérosols infectieux émis sur de courtes distances dans les atmosphères confinées (Fennelly 2020).En quelques mois, la COVID-19 est devenue pandémique, touchant une grande majorité de pays à travers le monde.Le 29 Février 2020, le premier cas d’infection d’un animal par le SARS-CoV-2 est déclaré à Hong-Kong. Il s’agit d’un chien Spitz nain âgé de 17 ans, placé sous quarantaine à la suite de l'hospitalisation de son propriétaire atteint de la COVID-19. L'animal n'a présenté aucun signe clinique spécifique. Les cinq prélèvements oraux et nasaux réalisés successivement entre le 26 Février et le 9 Mars se sont révélés « faiblement positifs » par RT-qPCR. Le virus a pu être isolé à partir de deux des prélèvements. Le 16 mars 2020, le chien est mort. Cependant, les autorités de Hong-Kong ont estimé que sa mort n’était pas imputable à son infection par le SARS-CoV-2. Un article (Sit et al. 2020) précise également que la séquence du virus obtenue chez le chien était très similaire1 à celle du virus isolé chez la propriétaire infectée.D’autres découvertes d’animaux de compagnie infectés ont été déclarées tout au long de l’année 2020. Au stade de la rédaction de l’avis, environ une soixantaine d’animaux de compagnie (des chats et des chiens) en contact étroit avec leur propriétaire atteint de la COVID-19, ont été détectés positifs par RT-qPCR à Hong-Kong, en Europe et aux États-Unis. Des animaux de zoos ont également été découverts infectés (Plateforme ESA2).Par ailleurs, le 23 Avril 2020, les Pays-Bas ont confirmé l’infection de deux élevages de visons par le SARS-CoV-2. Les animaux de ces deux élevages présentaient des signes respiratoires et gastro-intestinaux (Oreshkova et al. 2020). L’hypothèse privilégiée pour expliquer la dissémination du virus au sein des élevages est son introduction initiale aux visons par l’humain puis sa transmission entre les animaux.Plusieurs dizaines d’élevages de visons aux Pays-Bas et au Danemark, un élevage en Espagne et six aux États-Unis ont été détectés positifs au SARS-CoV-2 par RT-qPCR. Les animaux ne présentent pas toujours de signes cliniques.Dans le même temps, différentes équipes de recherche ont lancé des études d’infections expérimentales sur différentes espèces animales, afin de tester leur réceptivité et leur sensibilité à l’infection par le virus SARS-CoV-2.L’objectif de cet état des connaissances au 30 septembre 2020, est d’utiliser les données scientifiques disponibles pour donner un avis d’experts sur le rôle épidémiologique éventuel de certaines espèces animales dans la propagation du SARS-CoV-2.Le présent avis constitue ainsi également une mise à jour de l’avis complété 2020-SA-0037.