AppleBIOME: Microbiome and genetic analysis in apple germplasm towards broadening genetic resources to breed for resilient varieties
2023
Aranzana, Maria, José | Argilés, Ignasi | Bradlwarter, Markus | Didelot, Frédérique | Guerra, Walter | Holzknecht, Elias | Jung, Michaela | Keller-Przybylkowicz, Sylwia | Laurens, François | Letschka, Thomas | Lewandowski, Mariusz | Lozano, Lidia | Michalecka, Monika | Muranty, Hélène | Nogales, Amaia | Onielfa, Carles | Patocchi, Andrea | Pulawska, Joanna | Ray, David | Rymenants, Marijn | IRHS - Équipe VaDiPom (Valorisation de la Diversité des Pomoïdées) (IRHS-VADIPOM) ; Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS) ; Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) | IRHS - Équipe ResPom (Résistance du Pommier et du Poirier aux Bioagresseurs) (IRHS-RESPOM) ; Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS) ; Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
International audience
Show more [+] Less [-]English. The current high-input agriculture practices in commercial apple orchards are causing negative effects on agrobiodiversity and the ability to respond to climate change-related stresses. New breeding and management practices have the potential to break this cycle and develop diverse and resilient agroecosystems that require less pesticides and irrigation. The Apple BIOME project, funded by the 2022 Joint FACCE-JPI SusCrop, focuses on investigating the combined action of host and microbiome genetics (holobiont approach) under high and low-input management practices to boost the breeding for resilient varieties. The project uses an exceptional germplasm resource representing the broad genetic diversity of apple in Europe called "Apple REFPOP". The project involves six diverse biogeographical regions in Europe where the Apple REFPOP has been planted and managed under different conditions (high vs low pesticide and high vs low water input). The project aims to identify genomic regions contributing to stress response and estimating genomic predictive ability of traits under environmental stress. Additionally, the project analyzes the phyllosphere microbiome in the Apple REFPOP and commercial orchards to determine microbe-host relationships and identify microbiome-mediate stress response. The project will build on knowledge of the holobiont functional diversity in apple orchards to exploit microbiome-mediated resistance. Finally, the project will disseminate the results to stakeholders and create discussion forums to ensure the commercial uptake of the project outcomes.
Show more [+] Less [-]AGROVOC Keywords
Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Institut national de la recherche agronomique
