SARS-CoV-2 viral dynamics in infections with variants of concern in the French community
2021
Cosentino, Gina | Bernard, Mathieu | Ambroise, Joëvin | Giannoli, Jean-Marc | Guedj, Jérémie | Débarre, Florence | Blanquart, François | Infection et inflammation (2I) ; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | BIOLITTORAL-Biogroup - Plateau technique la Bastide, Sanary sur Mer, France | BPO-BIOEPINE- Biogroup [Levallois-Perret, France] | DYOMEDEA-NEOLAB-Biogroup-Plateau technique de la Sauvegarde, Lyon 9 France | Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)) ; Université Paris 13 (UP13)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Sorbonne Paris Cité (USPC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM) | Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB) ; Labex MemoLife ; École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
We analysed 871,604 PCR tests performed in the community in the Paris area (France) from 1st January 2021 to 24th March 2021. The PCR cycle threshold (Ct) at symptom onset was −1.33 (95% CI [-1.59,-1.07]) and −1.15 (95% CI [-1.57,-0.697]) lower for individuals infected with B.1.1.7 and B.1.351 compared to other strains. The mean duration of infectiousness after symptom onset (time to Ct > 31) was 8.6, 9.3, 8.9 days for individuals infected with historical strains, variants B.1.1.7 and B.1.351. This study clarifies the postsymptom intra-host dynamics of B.1.1.7 and B.1.351 and suggests that higher peak viral load for these variants may explain part of their evolutionary advantage and the greater pathogenicity of B.1.1.7.
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