Résistance aux carbapénèmes dans des communautés bactériennes de milieux hydriques contrastés à l’échelle de la métropole de Montpellier, France

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French. Contexte :La résistance aux carbapénèmes chez les bacilles à Gram négatif (BGN) est une préoccupation majeure en raison de leur capacité à hydrolyser les carbapénèmes, des antibiotiques essentiels pour traiter les infections sévères. Cette étude se concentre sur l’évaluation des communautés bactériennes résistantes dans différents compartiments hydriques de la métropole de Montpellier, afin de mieux comprendre la dynamique des gènes de résistance et leur circulation.Objectifs : Comparer les communautés bactériennes résistantes dans des eaux hospitalières, urbaines, naturelles souterraines, et de surface. Identifier les espèces et gènes de résistance aux carbapénèmes, en particulier les gènes blaKPC, blaOXA-48, blaNDM, et blaVIM.Méthodologie :Des prélèvements d'eau ont été effectués sur quatre sites pendant un an, avec une analyse des espèces résistantes et la détection des gènes de résistance par PCR. Les échantillons ont été cultivés en présence de différentes concentrations de méropénème.Résultats : Les genres bactériens communs à tous les compartiments incluent Acinetobacter, Aeromonas, Comamonas, Klebsiella, Pseudomonas, et Shewanella, suggérant un cycle de résistance aux antibiotiques entre ces milieux. Une grande diversité bactérienne a été observée, avec 3 840 souches identifiées, représentant 194 espèces. Les analyses de la diversité montrent des différences significatives d'alpha-diversité, mais pas de dissimilarités au niveau de la beta-diversité, ce qui suggère des échanges de gènes de résistance entre les compartiments.Conclusion :Les analyses d'alpha-diversité révèlent des différences significatives entre les différents compartiments hydriques étudiés. Cependant, aucune dissimilarité n'est observée au niveau de la beta-diversité, avec 8 genres bactériens communs à l'ensemble des compartiments. Par ailleurs, des indices de transferts horizontaux de gènes de résistance entre entérobactéries ont été détectés.Ces résultats suggèrent l'existence d'un cycle de résistance aux antibiotiques au sein de l'hydrosystème d'une métropole avec un haut niveau d'hygiène collective. Cela souligne un risque potentiel de diffusion de bactéries d'origine humaine dans l'environnement, si l’on considère LN comme un proxy de l’épidémiologie humaine.