The DeepFaune initiative: a collaborative effort towards the automatic identification of European fauna in camera trap images

Rigoudy, Noa | Dussert, Gaspard | Benyoub, Abdelbaki | Besnard, Aurélien | Birck, Carole | Boyer, Jérome | Bollet, Yoann | Bunz, Yoann | Caussimont, Gérard | Chetouane, Elias | Chiffard, Jules | Cornette, Pierre | Delestrade, Anne | de Backer, Nina | Dispan, Lucie | Le Barh, Maden | Duhayer, Jeanne | Elder, Jean-François | Fanjul, Jean-Baptiste | Fonderflick, Jocelyn | Froustey, Nicolas | Garel, Mathieu | Gaudry, William | Gérard, Agathe | Gimenez, Olivier | Hemery, Arzhela | Hemon, Audrey | Jullien, Jean-Michel | Knitter, Daniel | Malafosse, Isabelle | Marginean, Mircea | Ménard, Louise | Ouvrier, Alice | Pariset, Gwennaelle | Prunet, Vincent | Rabault, Julien | Randon, Malory | Raulet, Yann | Régnier, Antoine | Ribière, Romain | Ricci, Jean-Claude | Ruette, Sandrine | Schneylin, Yann | Sentilles, Jérôme | Siefert, Nathalie | Smith, Bethany | Terpereau, Guillaume | Touchet, Pierrick | Thuiller, Wilfried | Uzal, Antonio | Vautrain, Valentin | Vimal, Ruppert | Weber, Julian | Spataro, Bruno | Miele, Vincent | Chamaillé-Jammes, Simon | Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) ; Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-École Pratique des Hautes Études (EPHE) ; Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM) | Ecologie quantitative et évolutive des communautés [LBBE] ; Département écologie évolutive [LBBE] ; Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE) ; Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Parc national des Ecrins | Conservatoire d'Espaces Naturels Rhône-Alpes (CREN Rhône-Alpes) | Service conservation et gestion des espèces à enjeux (OFB SEE) ; OFB Direction de la recherche et de l’appui scientifique (OFB - DRAS) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB) | Fédération Départementale des Chasseurs de l'Ain | Auteur indépendant | Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA) ; Université Savoie Mont Blanc (USMB [Université de Savoie] [Université de Chambéry])-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Grenoble (Fédération OSUG)-Université Grenoble Alpes (UGA) | Service santé de la faune et fonctionnement des écosystèmes agricoles (OFB Service Santé Agri) ; OFB Direction de la recherche et de l’appui scientifique (OFB - DRAS) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB) | Institut du développement et des ressources en informatique scientifique (IDRIS) ; Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre de Recherches sur les Ecosystèmes d'Altitude (CREA Mont-Blanc) | Parc naturel régional du Perche | Centre de recherche et de formation en éco-éthologie (CERFE) ; Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA) | Parc Naturel Régional des Marais du Cotentin et du Bessin | Fédération Départementale des Chasseurs du Jura (FDCJ) | Parc national des Cévennes (PnC) ; Ministère de l'écologie de l'Energie, du Développement durable et de l'Aménagement du territoire | Institut Méditerranéen du Patrimoine Cynégétique et Faunistique | Service anthropisation et fonctionnement des écosystèmes terrestres (OFB SAFET) ; OFB Direction de la recherche et de l’appui scientifique (OFB - DRAS) ; Office français de la biodiversité (OFB)-Office français de la biodiversité (OFB) | Parc naturel régional des Ballons des Vosges | Ecomusée de la baie du Mont Saint-Michel | Fauna and Flora International [Cambridge, UK] | Obervatoire des Baronnies Provençales (OBP) | Géographie de l'environnement (GEODE) ; Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Parc National du Mercantour | Institut de recherche en informatique de Toulouse (IRIT) ; Université Toulouse Capitole (UT Capitole) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université de Toulouse (UT)-Toulouse Mind & Brain Institut (TMBI) ; Université Toulouse - Jean Jaurès (UT2J) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT) | Fédération Départementale des Chasseurs de la Drôme | Parc naturel régional de l’Aubrac | Nottingham Trent University | Office français de la biodiversité (OFB) | The DeepFaune team is funded by the CNRS, the University Lyon 1, the “Ecole Normale Supérieure de Lyon” and the “Programme National de Recherche en Intelligence Artificielle”. The CNRS provided additional financial support through its “Mission pour les Initiatives Transverses et Interdisciplinaires”. The following funders supported data collection through various programs (supported partners in parenthesis): Région Auvergne-Rhône-Alpes (FDC Drôme, Ain, Jura; CREA; PNR Baronnies Provençales), Région Sud-PACA (NR Baronnies Provençales), Réseau de Transport d’Electricité (CEFE), Fédération Nationale des Chasseurs (FDC Ain, Jura, Office Français de la Biodiversité (through the Ecocontribution, FDC Ain, Jura)), Conseils Départementaux de l’Ain et du Jura (FDC Ain, Jura), Fonds européens FEDER/POIA (CREA), Département de la Haute Savoie (CREA), Département de la Drôme (PNR Baronnies Provençales), Département des Hautes-Alpes (PNR Baronnies Provençales), Communauté de Communes Vallée de Chamonix (CREA), DREAL Bourgogne-Franche-Comté (FDC Jura), DREAL Auverge-Rhône-Alpes (FDC Ain), DREAL Normandie (PNR Perche), DREAL Centre-Val-de-Loire (PNR Perche), DREAL Occitanie (UMR GEODE), Fondation François Sommer (UMR GEODE), Fédération Départementale des Chasseurs de la Marne (CERFE), Réseau SNCF (CERFE), Autoroutes SANEF (CERFE), Nottingham Trent University, and Fauna & Flora International (B. Smith & A. Uzal & M. Marginean). Programme National de Recherche en Intelligence Artificielle.