Interactions between swine influenza A virus and alveolar macrophages: modulation of the immune response and impact on infection by porcine reproductive and respiratory syndrome virus | Interactions entre le virus influenza A porcin et les macrophages alvéolaires : modulation de la réponse immunitaire et impact de l'infection par le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin

English. The swine influenza A virus (swIAV) primarily targets respiratory epithelial cells but also interacts with alveolar macrophages (AM), which can modulate their immune response. swIAV is part of the porcine respiratory disease complex, along with the porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV), which replicates within AM. This thesis examines the interactions between these viruses during co- and super-infections, evaluating the impact of swIAV on 1) AM and their response to PRRSV, and 2) the immune response of pigs during subsequent infection with PRRSV.We showed in vivo that swIAV induces and increase in the expression of pro-inflammatory cytokines in AM up to three weeks after virus inoculation. Other in vitro studies revealed that swIAV replicates abortively in AM while inhibiting the replication of PRRSV, likely through the induction of type I interferon, an effect amplified when AM are co-cultured with epithelial cells. Finally, we showed in vivo that a primary infection with swIAV, inoculated one week before PRRSV, does not interfere with the early stages of the second infection. However, several parameters of the cellular antiviral response, including PRRSV-specific Th1 lymphocytes, are significantly increased, which could lead to faster clearance of the virus at later stages of infection in animals pre-infected with swIAV.The results highlight the complexity of interactions between viral infections and the importance of continuing research to better understand the underlying mechanisms and their implications for swine health

French. Le virus influenza A porcin (swIAV) cible principalement les cellules épithéliales respiratoires, mais interagit également avec les macrophages alvéolaires (AM), ce qui peut moduler leur réponse immunitaire. Le swIAV participe au complexe respiratoire porcin, tout comme le virus du syndrome dysgénésique et respiratoire porcin (PRRSV), qui lui se multiplie dans les AM. Cette thèse examine les interactions entre ces virus lors de co- et sur-infections, en évaluant du swIAV sur 1) les AM et leur réponse au PRRSV, et 2) la réponse immunitaire des porcs lors d'une infection subséquente par le PRRSV.Nous avons montré in vivo que le swIAV induit une augmentation de l'expression de cytokines pro-inflammatoires dans les AM jusqu'à trois semaines après l'inoculation du virus. D'autres études in vitro ont montré que le swIAV se réplique de façon abortive dans les AM tout en inhibant la réplication du PRRSV, probablement via l'induction d'interféron de type I, un effet amplifié lorsque les AM sont en co-culture avec des cellules épithéliales. Enfin, nous avons montré in vivo qu'une primo-infection par le swIAV, inoculé une semaine avant le PRRSV, n'interfère pas avec les stades précoces de la seconde infection. Cependant plusieurs paramètres de la réponse antivirale cellulaire, dont les lymphocytes Th1 spécifiques du PRRSV, sont significativement augmentés, ce qui pourrait entraîner une élimination plus rapide de ce virus à des stades tardifs de l'infection chez les animaux pré-infectés par le swIAV.Ces résultats soulignent la complexité des interactions entre les infections virales et l'importance de poursuivre les recherches pour mieux comprendre les mécanismes sous-jacents et leurs implications pour la santé porcine.