Genetic differentiation of four Italian walnut (Juglans regia L.) varieties by inter simple sequence repeat (ISSR)
2003
Pollegioni, P. (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Porano, Terni (Italy). Istituto di Biologia Agroambientale e Forestale) | Bartoli, S. (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Porano, Terni (Italy). Istituto di Biologia Agroambientale e Forestale) | Cannata, F. (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Porano, Terni (Italy). Istituto di Biologia Agroambientale e Forestale) | Malvolti, M.E. (Consiglio Nazionale delle Ricerche, Porano, Terni (Italy). Istituto di Biologia Agroambientale e Forestale)
English. In order to preserve and enhance the Italian walnut (Juglans regia L.) germplasm, ISSR markers for variety fingerprinting analysis were tested on four Italian varieties, two from the North (Bleggiana and Feltrina) and two from the South of Italy (Malizia and Sorrento). Nine primers generated 115 ISSR polymorphic markers. Genetic relationships among and within varieties were evaluated by multivariate analysis (PCA) and UPGMA phenograms based on Euclidean distances, Dice and Jaccard similarity coefficients. UPGMA was repeated on Jaccard´s similarity matrix computed on the basis of a sub set of 25 markers selected by correspondence analysis. Clear differentiation was found between Northern and Southern varieties as well as between Bleggiana and Feltrina, whereas the high genetic similarity observed between Sorrento and Malizia suggested the derivation of the latter genotype from the Sorrento variety
Show more [+] Less [-]Italian. [Allo scopo di conservare e migliorare il germoplasma italiano di noce (Juglans regia L.), sono stati saggiati marcatori ISSR per la tipizzazione del DNA in quattro varietà italiane, due dell´Italia Settentrionale (Bleggiana e Feltrina) e due dell´Italia Meridionale (Malizia e Sorrento). Nove primer hanno generato 115 marcatori polimorfici ISSR. Le relazioni filogenetiche fra e nell´ambito delle varietà sono state valutate mediante l´analisi multivariata (PCA) e fenogrammi UPGMA basati sulle distanze euclidee e i coefficienti di similarità di Dice e Jaccard. L´UPGMA è stato ripetuto sulla matrice di similarità di Jaccard calcolata sulla base di un sottoinsieme di 25 marcatori selezionati mediante l´analisi di corrispondenza. È stata trovata una chiara differenziazione fra varietà settentrionali e meridionali, così come fra Bleggiana e Feltrina, mentre la similarità genetica elevata osservata fra Sorrento e Malizia fanno ipotizzare che quest´ultimo genotipo derivi dalla varietà Sorrento.]
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