Genetic characterisation of coat protein gene of Betanodavirus isolates from different fish species [Italy; California]
2004
Ciulli, S. | Natale, A. | Battilani, M. | Prosperi, S.
English. Betanodavirus isolates from different fish species were characterised at coat protein gene level. Brain samples were isolated on SSN-1 cell culture, RNA was extracted and more that 97% of coat protein gene amplified and sequenced. Sequences were compared with Betanodavirus coat protein sequences available from Genbank. Eight Italian sea bass strain, 2 Italian grouper strains and one Californian white sea bass strain were classified in RGNNV genotype. No host or geographic clustering was evidenced from phylogenetic analysis
Show more [+] Less [-]Italian. [Sono stati caratterizzati isolati di Betanodavirus derivanti da specie ittiche diverse, a livello del gene della proteina capsidica. Campioni di cervello sono stati isolati su coltura di cellule SSN-1, è stato estratto l'RNA ed è stato amplificato e sequenziato più del 97% del gene della proteina capsidica. Le sequenze sono state confrontate con le sequenze del gene della proteina capsidica di Betanodavirus disponibili su GenBank. Otto ceppi derivanti da branzini italiani, due ceppi da cernie italiane e un ceppo da Atractoscion nobilis della California sono stati classificati nel genotipo RGNNV. Dall'analisi filogenetica non è stato evidenziato nessun raggruppamento per specie di origine o regione di provenienza.]
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