The molecular characterisation of a population of Caqueteño cattle and their phylogenetic relationship with Colombian creole cattle breeds | Caracterizacion molecular de una poblacion de ganado Caqueteño y su relacion filogenetica con razas bovinas criollas colombianas

Spanish; Castilian. el objetivo fue determinar si una poblacion de la raza bovina criolla Caqueteño (CaQ) representa una agrupacion racial diferente de las demas poblaciones criollas bovinas colombianas. a tal fin se realizo extraccion de aDN a partir de muestras de sangre tomadas a 80 animales Caqueteño; ademas, se usaron 126 muestras de aDN pertenecientes a seis razas criollas colombianas, 19 muestras de aDN tomadas de animales Cebu (Bos indicus) y 14 de una raza española autoctona. Para caracterizar la poblacion se utilizaron 14 marcadores moleculares tipo microsatelite para los cuales se identificaron los genotipos mediante PCR y electroforesis. en la poblacion CaQ se encontro un numero promedio de alelos (NPa= 9,21) superior a las demas razas evaluadas, que variaron entre NPa= 4,57 y NPa= 8,57 para las razas Sanmartinero y BoN, respectivamente. La endogamia, definida mediante el indice de fijacion (Fis), fue similar a otras razas criollas (0,14) y se encuentra dentro de los parametros reportados en otros trabajos. Los menores valores de distancias geneticas fueron encontrados entre la poblacion CaQ y las razas BoN (0,15) y Romosinuano (0,17) y se constato una distancia considerable con la raza Cebu (0,27). en general, los analisis genotipicos muestran que el biotipo CaQ presenta uniformidad racial con introgresion moderada de la raza cebu, por lo que puede considerarse como un grupo racial definido que puede ser utilizado para un programa de conservacion

English. The object of this work was to determine whether a population of Caqueteño creole cattle (CAC) represented a racial grouping different to other Colombian creole populations. DNA was thus extracted from blood-samples taken from 80 CAC animals; 126 samples of DNA from six Colombian creole breeds, 19 DNA samples from zebu animals (Bos indicus) and 14 from an autochthonous Spanish breed were also used. 14 micro-satellite molecular markers were used for characterising the population, their genotypes being identified by PCR and electrophoresis. A greater average number of alleles (ana=9.21) was found in the CAC population than in the other breeds being evaluated, varying from ana=4.57 to ana=8.57 for Sanmartinero and BON breeds, respectively. Endogamy, defined by fixation index (Fis), was similar to other creole breeds (0.14), coming within parameters reported in other work. The smallest genetic distance values were found between the CAC population and BON (0.15) and Romosinuano (0.17) breeds, though a considerable distance was found from the zebu breed (0.27). Genotyping analysis generally revealed that the CAC biotype presented racial uniformity, the zebu breed having moderate introgression, meaning that it could be considered to be a defined racial group which could be used for a conservation programme