Proteomics: a tool for the study of plant response to abiotic stress
2011
Gabriel Roveda Hoyos | Liz P. Fonseca Moreno
English. Due in part to human activity, changes in global climate behavior have manifested in an increase in extreme temperature related events such as drought, salinization, contamination and flooding of vast areas of the planet. Regarding agricultural activity, these uncertain climatic scenarios are likely to cause biotic and abiotic stress increases, which must be dealt with through science and technology. Holistic approaches, also known as "omics": proteomics, genomics, transcriptomics, and metabolomics offer new ways of facing these coming climate changes. Proteomics provide a new approach to the identification of proteins of interest and to carry out a functional analysis of the genome and its relationship with the environment. New advances in proteomics include the use of highly efficient techniques such as bi-dimensional electrophoresis, multi-dimensional chromatography, mass spectrometry and second generation technologies for the analysis of polypeptides and proteins at tissue, organ, organelle and membrane levels, as well as bioinformatic tools. This review article is comprised of aspects related to the general model of stress in plants, and advances in proteomics which contribute to the understanding of water and salt stress in cereals of economic importance. Key words: water deficit, salinity, omics, ABA.
Show more [+] Less [-]Los cambios en el comportamiento climático global, como consecuencia en parte de la actividad humana, se manifiestan con el incremento en la intensidad de eventos relacionados con temperaturas extremas, sequía, salinización, contaminación y anegación de extensas áreas del planeta. Estos nuevos escenarios climáticos de mayor incertidumbre para la actividad agrícola se relacionan con el aumento en la incidencia de estreses bióticos y abióticos, que deberán ser abordados desde el conocimiento científico y la tecnología. Las aproximaciones de carácter holístico, conocidas como "Ómicas", genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica ofrecen nuevas oportunidades para enfrentar los cambios climáticos venideros. La proteómica proporciona una nueva aproximación que permite identificar proteínas de interés y realizar un análisis funcional del genoma y de su relación con el ambiente. Los nuevos avances en proteómica incluyen el uso de tecnologías de alta eficiencia como la electroforesis bidimensional, la cromatografía multidimensional, la espectrometría de masas y tecnologías de segunda generación, que junto con herramientas de bioinformática permiten el análisis de polipéptidos y proteínas a nivel de tejidos, órganos, organelos y membranas. Este artículo de revisión, comprende aspectos relacionados con el modelo general de estrés en plantas y avances de la proteómica en la comprensión del estrés hídrico y salino en cereales de importancia económica. Palabras clave: déficit hídrico, salinidad, ómicas, ABA
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Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Corporación colombiana de investigación agropecuaria