Choosing an approach for identification of soil coccoid green microalgae (Trebouxiophyceae, Chlorophyta) | Выбор подхода при идентификации почвенных коккоидных зеленых микроводорослей (Trebouxiophyceae, Chlorophyta)
2018
Temraleeva, A.D. | Moskalenko, S.V. | Portnaya, E.A., Russian Academy of Sciences, Moscow Region (Russian Fedeartion). Institute of Physicochemical and Biological Problems of Soil Science
English. The article describes the morphological and molecular genetic approaches used to identify the green microalgae of the Trebouxiophyceae class from the ACSSI collection. In the brown semi-desert and chestnut soils, we found Muriella terrestris. In the buried meadow-chestnut soil we found Edaphochlorella mirabilis. Three more strains are characterized as new uncharacterized taxa: ACSSI 014 is a new species related to the genus Watanabea isolated from gray forest soil, with a pyrenoid surrounded by several starch grains, in contrast to the type species, and ACSSI 104 and 144 are a Nannochloris-like genus, whose representatives were found in solonetz and chestnut soil and are characterized by poor morphological specificities. It is shown that use any single criterion (either morphological or other specificity, calculation of genetic distances, analysis and comparison of the ITS2 secondary structure, search for compensatory changes and molecular signatures) does not allow reliable classification of taxa. Therefore, due to this fact, it is necessary to apply a polyphasic approach in the systematics of algae, especially when identifying taxa with simple cellular morphology, which are often found in soils.
Show more [+] Less [-]Russian. Описываются морфологический и молекулярно-генетический подходы, использованные при идентификации зеленых микроводорослей класса Trebouxiophyceae из коллекции ACSSI. В бурой полупустынной и каштановой почвах были обнаружены водоросли Muriella terrestris, в погребенной лугово-каштановой почве – Edaphochlorella mirabilis. Еще 3 штамма являются новыми неописанными таксонами: ACSSI 014 – новый вид рода Watanabea, изолированный из серой лесной почвы и имеющий пиреноид с крахмальной обверткой в отличие от типового вида, и ACSSI 104 и 144 – Nannochloris-подобный род, представители которого найдены в солонце и каштановой почве и обладают скудными морфологическими признаками. Показано, что ни один критерий в отдельности (морфологический или иной признак, вычисление генетических дистанций, анализ и сравнение вторичной структуры ITS2, поиск компенсаторных замен и молекулярных подписей) не позволяет надежно классифицировать таксоны, поэтому в систематике водорослей необходимо использовать полифазный подход. Это особенно актуально при идентификации таксонов с простой клеточной морфологией, которые часто встречаются в почвах.
Show more [+] Less [-]AGROVOC Keywords
Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Central Scientific Agricultural Library