Outils de diagnostic, épidémiologie d’Alternaria dauci sur carotte porte-graine et méthodes de lutte

Alternaria dauci est un pathogène affectant fréquemment les semences de carotte avec des répercussions sur la faculté germinative. Les travaux menés ont permis la mise au point d’outils de détection basés sur des amorces PCR des régions ITS, presque exclusivement spécifiques de l’espèce Alternaria dauci. Des outils d’identification intraspécifiques à partir des régions IGS et de loci micro satellites ont également pu être mis au point, et mettre en évidence la grande variabilité génétique de l’espèce A. dauci. Au plan épidémiologique, une clé d’identification des brûlures foliaires a été établie. Il a pu être démontré que la plante est sensible au pathogène quel que soit son stade de développement, mais les conditions climatiques propices au développement du pathogène n’ont pu être clairement établies. L’étude de l’efficacité de produits fongicides a permis de mettre en avant 3 spécialités efficaces (SIGNUM, AMISTAR et dans une moindre mesure TWIST), et de démontrer l’existence de souches résistantes à l’iprodione. Enfin, le modèle Tomcast, adapté pour l’alternariose sur carotte par le CTIFL, a fait l’objet de premiers tests d’application sur porte-graine au cours de ce programme. Ce modèle est actuellement en cours de développement.

Alternaria dauci is a fungal seed-borne pathogen responsible for the leaf blight disease on carrots that has a negative impact on seed germination efficiency. In this study, molecular diagnostic tools based on PCR amplification of the ITS region with species-specific primers were developed. Polymorphism analyses at several microsatellite loci and in the intergenic spacer (IGS) sequence revealed a high genetic diversity within the species A. dauci. From an epidemiological point of view, an identification key for leaf blight was established. It has been shown that the host plant is susceptible to fungal pathogen infection irrespective of its developmental stage but climatic conditions favouring disease development could not be clearly established. Screening different fungicide treatments revealed that three specialities were efficient to control the disease (SIGNUM, AMISTAR, and to a lesser extent TWIST) but iprodione-resistant strains were identified. Preliminary tests of the Tomcast model, adapted to carrot Alternaria leaf blight (CTIFL), were conducted in seed production during this project. Additional tests using this model are currently performed.