Variabilité et déterminisme génétique des traits de vie impliqués dansl’évolution de l’agressivité et l’adaptation à la résistance partielle

La recherche des traits impliqués dans la virulence et adaptatifs pour un hôte ou son parasite,l’étude des compromis entre ces traits et des bases génétiques de ces traits, sont cruciales pourla compréhension de l’évolution de la virulence. Dans les pathosystèmes cultivés, la virulence(classiquement définie comme la baisse de fitness infligée à l’hôte par son parasite) estremplacée par la notion de pouvoir pathogène défini comme la quantité de dommages infligéeà l’hôte. Une partie du pouvoir pathogène dépend d’interactions spécifiques qualitatives detype gène pour gène prenant de facto en compte la variabilité des génotypes hôtes et parasites.Par contre, très peu de travaux intégrant les interactions génotype X génotype (G X G) ontporté sur l’agressivité, composante qualitative du pouvoir pathogène, qui correspond à laréponse du parasite aux résistances partielles des hôtes. Nous étudions l’adaptation dupathogène fongique modèle Magnaporthe oryzae aux résistances partielles du riz. Nous avonsrecherché des traits adaptatifs impliqués dans l’agressivité en prenant en compte lesinteractions G X G, étudié les corrélations entre traits, et recherché leurs bases génétiques.Nous avons d’abord testé 18 isolats de M. oryzae représentatifs de la diversité génétiquemondiale sur une variété de riz très sensible. Le nombre de lésions par feuille, la taille deslésions, le nombre de spores par unité de surface de lésion ont été mesurés. Les résultats ontmontré des différences significatives entre souches pour les 3 traits évalués. Ces données nousdonnent accès à l’héritabilité des caractères mesurés. Nous avons ensuite testé 4 des 18 isolatsprécédents sur 4 variétés de riz de niveaux de résistance variables et mesuré les mêmescaractères. Nous avons détecté des variations significatives entre souches pour tous lesfacteurs mesurés, ainsi que des interactions G X G. Des essais préliminaires ont également étéréalisés sur la capacité de transmission à des plantes saines. Enfin, un croisement sexué a étéréalisé entre les 2 souches ayant des positions extrêmes dans les gammes de variation destraits. Deux cents descendants ont été générés, et génotypés avec 35 marqueursmicrosatellites. Cette carte sera complétée par 300 marqueurs développés à partir desgénomes complets des 2 parents, qui seront acquis courant 2010. Cette densité devraitpermettre de cartographier finement les QTL sous-tendant les traits impliqués dansl’adaptation aux résistances partielles.