Identification of cyanobacteria in Lagoa Salgada by metagenomic approach, Rio de Janeiro, Brazil | Identificação de cianobactérias na Lagoa Salgada por abordagem metagenômica, Rio de Janeiro, Brasil

unknown. Lagoa Salgada is a coastal hypersaline water body located in the north of Rio de Janeiro State and recognized by the presence of stromatolites. Cyanobacteria are the main primary producers of these structures in coastal hypersaline lagoons. The aim of the study was to identify the cyanobacteria present in Lagoa Salgada through metagenomics. The genetic material obtained from a water sample collected in June 2019 was submitted to sequencing by the shotgun method. The metagenomic data were analyzed using the MetaWrap version 1.3 pipeline to identify cyanobacteria and biological processes. The genus Synechococcus showed greater abundance, corresponding to 64.3% of the identified cyanobacteria, followed by Synechocystis (23.6%), Geminocystis (2%), and Calothrix (1.8%). The most abundant species were Synechococcus sp. RS9909 (46.7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16.4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9.2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4.3%). Thirty-three biological processes associated with genes present in the sample were identified. The Lagoa Salgada has a wide diversity of cyanobacteria in its aquatic ecosystem that is still little explored, justifying the need for protection and preservation of this lagoon environment.

unknown. A Lagoa Salgada é um corpo aquático hipersalino costeiro localizado no norte do Estado do Rio de Janeiro e reconhecido pela presença de estromatólitos. As cianobactérias são os principais produtores primários dessas estruturas em lagoas hipersalinas costeiras. O objetivo do estudo foi identificar as cianobactérias presentes na Lagoa Salgada por meio da metagenômica. O material genético obtido de uma amostra de água coletada no mês de junho de 2019 foi submetido ao sequenciamento pelo método shotgun. Os dados metagenômicos foram analisados utilizando o pipeline MetaWrap versão 1.3 para identificação das cianobactérias e dos processos biológicos. O gênero Synechococcus apresentou maior abundância correspondendo por 64,3% das cianobactérias identificadas, seguidos por Synechocystis (23,6%), Geminocystis (2%) e Calothrix (1,8%). As espécies mais abundantes foram Synechococcus sp. RS9909 (46,7%), Synechocystis sp. PCC 6714 (16,4%), Synechococcus sp. WH 8101 (9,2%), Synechocystis sp. CACIAM 05 (4,3%). Foram identificados 33 processos biológicos associados aos genes presentes na amostra. A Lagoa Salgada apresenta uma ampla diversidade de cianobactérias em seu ecossistema aquático ainda pouco explorado, fundamentando a necessidade de proteção e preservação deste ambiente lagunar.