Reconocimiento de miRNAs y su relación con la expresión de genes de clavel (Dianthus caryophyllus) involucrados en la respuesta al patógeno Fusarium oxysporum f. sp. dianthi | Recognition of miRNAs and their relationship with the expression of carnation (Dianthus caryophyllus) genes involved in the response to the pathogen Fusarium oxysporum f. sp. dianthi

La producción de clavel a nivel mundial sufre grandes pérdidas por el marchitamiento vascular causado por el patógeno Fod (Fusarium oxysporum f. sp. dianthi). Por lo que Los trabajos relacionados con el mecanismo de respuesta de variedades naturalmente resistentes, podría ser el primer paso para la producción de variedades comerciales resistentes a Fod. En este estudio se fabricaron librerías de miRNA de dos variedades. 395 resistente y SH2 susceptible a Fod, en dos tratamientos: antes de la elicitación y después de la elicitación. Se encontraron miRNAs putativos que regulan la expresión de alguno de los 35 genes muestra. Estos genes muestran variaciones importantes en sus niveles de expresión durante la elicitación con Fod. Esto se determinó en trabajos anteriores en el laboratorio de Biotecnología vegetal de la Universidad Militar Nueva Granada. Estos miRNAs fueron validados y su perfil de control postranscripcional fue relacionado con el mecanismo de respuesta de ambas variedades. Se encontró que ambas variedades responden mediante el mismo perfil de control postranscripcional y tienen un mecanismo de respuesta similar. Sin embargo, 395 controla postranscripcionalmente los genes adecuados en el momento oportuno para responder de manera efectiva. Mientras que SH2 no tiene esa misma eficiencia, lo que no le permite ser oportuno en la respuesta ante Fod. Se proponen 84 miRNAs putativos en total que están controlando los mecanismos de expresión de 26 de los 35 genes al momento de la elicitación. Realizar experimentos de “Knock out” o “Knock down” sobre estos 84 miRNAs podría mostrar perdida o ganancia de resistencia a Fod, lo que permitiría concluir que estos miRNAs son claves para el mecanismo de respuesta de variedades resistentes de clavel ante Fod.

Carnation production worldwide suffers great losses due to vascular wilt caused by the pathogen Fod (Fusarium oxysporum f. sp. dianthi). Therefore, the work related to the response mechanism of naturally resistant varieties could be the first step to produce commercial varieties naturally resistant to Fod. In this study, miRNA libraries of two varieties were fabricated. 395 resistant and SH2 susceptible, in two treatments: before elicitation and after elicitation. Putative miRNAs that regulate the expression of some of the 35 sample genes were found. These genes show important variations in their expression levels upon chemical contact with Fod. This was determined in previous works in the phytopathology laboratory of the Universidad Militar Nueva Granada. These miRNAs were validated, and their post-transcriptional control profile was related to the response mechanism of both varieties. Both strains were found to respond through the same post-transcriptional control profile and have a similar response mechanism. However, 395 is more efficient in its post-transcriptional control effort, controlling the appropriate genes to respond effectively. While SH2 does not have the same efficiency, which does not allow it to be timely in response to Fod. A total of 84 putative miRNAs are proposed that are controlling the expression mechanisms of 26 of the 35 genes at the time of elicitation. Performing "Knock out" or "Knock down" experiments on these 84 miRNAs can show loss or gain of resistance to Fod, which would allow us to conclude that these miRNAs are key to the response mechanism of carnation resistant varieties to Fod.

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