علاقة التباين الوراثي في جين JAK1 والاهبة للأصابة بفايروس التهاب الكبد الفايروسي C في العراق | Genetic Variants in JAK1 Gene and Susceptibility to Hepatitis C Viral Infection in Iraq

Arabic. تمثل الإصابة بالتهاب الكبد الفايروسي نوع C  ( (HCVتحد عالمي باصابة أكثر من 180 مليون شخصا على عموم العالم. هناك نسبة قليلة فقط من المرضى يتخلصون من الفايروس بصورة تلقائية، في حين ان معظم المرضى يؤولون الى الطور المزمن من المرض، مما يعكس الدور الاساسي للعوامل الوراثية في التخلص من الفايروس أو بقاءه. هدفت الدراسة الحالية الى استقصاء تأثير تباينات جينية معينة في جين JAK1 على مدى أهبة الفرد للخمج ﺑHCV . شملت الدراسة 60 مريضا بالتهاب الكبد الفايروسي نوع C اضافة الى 35 شخصا صحيحا ظاهريا. جمعت عينات دم من مجتمع الدراسة وتم استخلاص الحامض النووي منزوع الاوكسجين من هذه العينات. تمت مضاعفة جين JAK1 بتقنية PCR التقليدية باستخدام  ثلاثة ازواج من البادئات التي استهدفت ثلاث تغايرات جينية في هذا الجين وهي: rs2780895 و rs4244165و rs17127024. ظهر كل من التباين الجيني rs2780895 و rs17127024 بنمطين جينيين في كل من المرضى والاصحاء، غير ان النمط الجيني المتغاير للتباين rs2780895 (CT) هو الوحيد الذي كانت له علاقة معنوية مع الاهبة للخمج ﺑHCV . أما التباين الجيني rs4244165 فقط ظهر بنمط جيني واحد (GG) في كل من المرضى والأصحاء. تشير نتائج هذه الدراسة الى ان الاليل T  للتباين الجيني rs2780895 يمكن ان يعد عامل خطورة للخمج ﺑHCV .

English. Infection with hepatitis C virus (HCV) imposes a global challenge with over 180 million cases worldwide. Only few patients spontaneously had their virus neutralized, while most patients develop chronic HCV infection. This implies a key role of genetic factors in viral clearance or persistence. The current study aimed at clarifying the effect of certain single nucleotide polymorphisms (SNPs) on individual's susceptibility to HCV infection.  A total of 60 patients with confirmed HCV infection and 35 apparently healthy individuals were enrolled in this study. Blood sample was obtained from each participant, from which DNA was extracted. The JAK1gene was amplified with conventional PCR technique using three sets of primers targeting three SNPs in this gene: rs2780895, rs4244165 and rs17127024. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) was used for genotyping of PCR products. Each of rs2780895 and rs17127024 had two genotypes in both patients and controls, however, only the heterozygous genotype of the SNP rs2780895 (CT) significantly associated with the susceptibility to HCV. The SNP rs4244165 appeared in only with homozygous wild genotype (GG) in both patients and controls. It can be concluded that allele T of the SNP rs2780895 could be considered as a risk factor for infection with HCV