Reconstructing Neutral-Lipids Metabolic Pathways of a Metagenomic Dataset from Ushuaia Bay Sediments
2020
Pascutti, Federico | Sandoval, Natalia Elisa | Galvan, Virginia | Lanfranconi, Mariana Patricia | Arabolaza, Ana Lorena | Alvarez, Hector Manuel | Gramajo, Hugo Cesar | Dionisi, Hebe Monica
Bacterial production of neutral lipids such as triacylglycerides, wax-esters and polyhydroxyalcanoates (TAG, WE and PHA-B, respectively) has been reported in Gammaproteobacteria and Actinobacteria. Within them, there is a short list of microorganisms with an in-depth study of the metabolic route involved in the synthesis of these compounds. To increase our knowledge of the potential of sediment bacteria in relation to this process, we analyzed homolog sequences of the key enzyme involved in TAG biosynthesis, the wax synthase/diacylglycerol acyltransferase (WS/DGAT), from a metagenomic dataset of a chronically-polluted Subantartic coastal environment, and their genomic context. Almost half of putative WS/DGAT sequences were related to those identified in genomes from members of the Actinobacteria phylum, mainly from the Acidimicrobiia, Actinobacteria and Nitriliruptoria classes, while 34% of the sequences shared higher identity values with WS/DGAT homologs from Proteobacteria (Gammaproteobacteria, followed by Alpha-, Beta- and Deltaproteobacteria).
Show more [+] Less [-]Fil: Pascutti, Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Sandoval, Natalia Elisa. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Galvan, Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Lanfranconi, Mariana Patricia. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Arabolaza, Ana Lorena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Alvarez, Hector Manuel. Universidad Nacional de la Patagonia "San Juan Bosco". Instituto de Biociencias de la Patagonia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Instituto de Biociencias de la Patagonia; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Gramajo, Hugo Cesar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
Show more [+] Less [-]Fil: Dionisi, Hebe Monica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Centro Nacional Patagónico. Centro para el Estudio de Sistemas Marinos; Argentina
Show more [+] Less [-]LVI SAIB Meeting; XV SAMIGE Meeting
Show more [+] Less [-]Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Show more [+] Less [-]Argentina
Show more [+] Less [-]Sociedad Argentina de Investigación Bioquímica
Show more [+] Less [-]Sociedad Argentina de Microbiología General
Show more [+] Less [-]Bibliographic information
This bibliographic record has been provided by Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas