Ecology, evolution, and epidemiology of zoonotic and vector-borne infectious diseases in French Guiana: Transdisciplinarity does matter to tackle new emerging threats

de Thoisy, Benoît | Duron, Olivier | Epelboin, Loïc | Musset, Lise | Quénel, Philippe | Roche, Benjamin | Binetruy, Florian | Briolant, Sébastien | Carvalho, Luisiane | Chavy, Agathe | Couppié, Pierre | Demar, Magalie Pierre | Douine, Maylis | Dusfour, I. | Gourbière, Sébastien | Epelboin, Yanouk | Flamand, Claude | Franc, Alain | Ginouvès, Marine | Houël, Emeline | Kocher, Arthur | Lavergne, Anne | Le Turnier, Paul | Mathieu, Luana | Murienne, Jérôme | Nacher, Mathieu | Schaub, Roxane | Pelleau, Stéphane | Prévot, Ghislaine | Rousset, Dominique | Roux, Emmanuel | Talaga, Stanislas | Thill, Pauline | Tirera, Sourakhata | Guégan, Jean-François | Laboratoire des Interactions Virus-Hôtes [Cayenne, Guyane Française] ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Centre de Recherche en Ecologie et Evolution de la Santé (CREES) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC) ; Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie]) | Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française] | Centre National de Référence du Paludisme [Cayenne, Guyane française] (CNR - laboratoire associé) ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Centre Collaborateur OMS pour la surveillance de la résistance aux antipaludiques - WHO Collaborating Center for Surveillance of Anti-malarial Drug Resistance [Cayenne, Guyane française] (CCOMS) ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office [Genève, Suisse] (OMS / WHO) | Laboratoire de Parasitologie [Cayenne, Guyane française] ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Institut de recherche en santé, environnement et travail (Irset) ; Université d'Angers (UA)-Université de Rennes (UR)-École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes (Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique) | École des Hautes Études en Santé Publique [EHESP] (EHESP) | Centre de Recherches Ecologiques et Evolutives sur le Cancer (MIVEGEC-CREEC) ; Processus Écologiques et Évolutifs au sein des Communautés (PEEC) ; Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC) ; Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Maladies infectieuses et vecteurs : écologie, génétique, évolution et contrôle (MIVEGEC) ; Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie])-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD [Occitanie]) | Vecteurs - Infections tropicales et méditerranéennes (VITROME) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Aix Marseille Université (AMU)-Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Brétigny-sur-Orge] (IRBA) | Institut de Recherche Biomédicale des Armées [Antenne Marseille] (IRBA) | Santé publique France Guyane ; Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France] | Université de Guyane (UG) | Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL) ; Institut Pasteur de Lille ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre d'investigation clinique Antilles-Guyane (CIC - Antilles Guyane) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pointe-à-Pitre / Abymes [Guadeloupe]-Centre Hospitalier Andrée Rosemon [Cayenne, Guyane Française]-Centre Hospitalier Universitaire de Martinique [Fort-de-France, Martinique] (CHU de Martinique) | Département de Santé Globale - Department Global Health ; Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité) | Laboratoire Génome et développement des plantes (LGDP) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Vectopôle Amazonien Emile Abonnenc [Cayenne, Guyane française] ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Unité d'Epidémiologie [Cayenne, Guyane française] ; Institut Pasteur de la Guyane ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Modélisation mathématique des maladies infectieuses - Mathematical modelling of Infectious Diseases ; Institut Pasteur [Paris] (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité) | Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Pleiade, from patterns to models in computational biodiversity and biotechnology (PLEIADE) ; Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI) ; Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Inria de l'Université de Bordeaux ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Biomes Tropicaux et Immuno-Pathophysiologie = Tropical Biome and ImmunoPhysiopathology [Lille] (TBIP) ; Centre d’Infection et d’Immunité de Lille - INSERM U 1019 - UMR 9017 - UMR 8204 (CIIL) ; Institut Pasteur de Lille ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur de Lille ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [CHU Lille] (CHRU Lille)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Guyane (UG) | Ecologie des forêts de Guyane (UMR ECOFOG) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-AgroParisTech-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | Max Planck Institute for the Science of Human History (MPI-SHH) ; Max-Planck-Gesellschaft | Evolution et Diversité Biologique (EDB) ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) | Centre d’Investigation Clinique de Nantes (CIC Nantes) ; Université de Nantes (UN)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital (CHU Nantes) | Centre Hospitalier Universitaire de Nantes = Nantes University Hospital (CHU Nantes) | Malaria : parasites et hôtes - Malaria : parasites and hosts ; Institut Pasteur [Paris] (IP) | Institut Pasteur [Paris] (IP) | UMR 228 Espace-Dev, Espace pour le développement ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Perpignan Via Domitia (UPVD)-Avignon Université (AU)-Université de La Réunion (UR)-Université de Montpellier (UM)-Université de Guyane (UG)-Université des Antilles (UA) | LMI Sentinela [Rio de Janeiro] ; Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Universidade de Brasilia = University of Brasilia [Brasília] (UnB)-Fundação Oswaldo Cruz / Oswaldo Cruz Foundation (FIOCRUZ) ; Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur)-Pasteur Network (Réseau International des Instituts Pasteur) | Service Universitaire des Maladies Infectieuses et du Voyageur [Tourcoing] ; Centre Hospitalier Tourcoing | Centre Hospitalier Gustave Dron [Tourcoing] | Animal, Santé, Territoires, Risques et Ecosystèmes (UMR ASTRE) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE) | This work has benefited from three “Investissement d’Avenir” grants managed by Agence Nationale de la Recherche (CEBA: ANR-10-LABX-25-01; TULIP: ANR-10-LABX-0041; DRIIHM: ANR-11-LABX-0010). The two lead coauthors received European funding through the European Regional Development Fund Operational Program FEDER RESERVOIRS Project (BdT) and a US NSF-NIH (NSF#1911457) Ecology of infectious diseases award (J-FG). J-FG is also supported by IRD, INRAE, and Université of Montpellier. OD thanks l’Office français de la biodiversité, le Groupe d'Étude et de Protection des Oiseaux en Guyane (GEPOG), la Direction de l'Alimentation, de l'Agriculture et de la Forêt de Guyane (DAAF). AL acknowledges European funding through the European Regional Development Fund Operational Program FEDER RESERVOIRS, CAROLLIA, EFAG and VIRUSES projects. LM is supported by European funding through the European Regional Development Fund Operational Program FEDER ELIMALAR project and Santé publique France as the National Reference Center for Malaria. PQ thanks Publique France/Cire Guyane, CNR sur les arboviroses, CNR du paludisme. EH and ID acknowledge European funding through the European Regional Development Fund Operational Program FEDER CONTROLE Projet, the French Guiana Regional Council and the Air Liquide Foundation. SB is supported by the French Army (Grant LR607e). ER is grateful for European funding through the European Regional Development Fund Operational Program FEDER OSE-Guyamapa project, the French Embassy in Brazil, the Guyamazon program ("GAPAM-Sentinela" project), CNES, and the Bill and Melinda Gates Foundation. | ANR-10-LABX-0025,CEBA,CEnter of the study of Biodiversity in Amazonia(2010) | ANR-10-LABX-0041,TULIP,Towards a Unified theory of biotic Interactions: the roLe of environmental(2010) | ANR-11-LABX-0010,DRIIHM / IRDHEI,Dispositif de recherche interdisciplinaire sur les Interactions Hommes-Milieux(2011)