Étude de la diversité de souches de Xanthomonas responsables de la graisse commune du haricot, et de leurs effecteurs TAL

English. Xanthomonas citri pv. fuscans (Xcf) and Xanthomoas phaseoli pv. phaseoli (Xpp) are the pathogens responsible for the common bacterial blight of bean. Four genetic lineages were identified from these two pathovars: fuscans, GL2, GL3, and GL1. The pathogenicity of these strains is based on a repertory of various effectors such as TAL effectors. However, the diversity of TALEs within these lineages were poorly described. An analysis of the diversity of the strains and TALEs was conducted on a collection of 144 Xcf-Xpp strains via an MLVA approach. Here, we showed that the GL1 strains present a high diversity of strains and TALEs and that the GL2 strains are not endemic to Reunion as previously assumed. Our results give a description of the diversity of Xcf-Xpp strains present in the different bean production areas when the collection was established. They allow to conclude which lineage and TAL effectors are the most present in these production areas. The development of MLVA analysis on these strains will make possible to carry out epidemiological monitoring on Xcf-Xpp allowing to identify the different routes of introduction of the strains and to set up control strategies. The analysis of the TAL effectors will allow to identify the sources of resistance to these effectors.

French. Xanthomonas citri pv. fuscans (Xcf) et Xanthomoas phaseoli pv. phaseoli (Xpp) sont les agents pathogènes responsables de la maladie de la graisse commune sur haricot. Quatre lignées génétiques ont été identifiées parmi ces deux pathovars: fuscans, GL2, GL3, and GL1. Le pouvoir pathogène de ces souches repose sur un répertoire d'effecteurs tels que les TALE. Toutefois, la diversité des TALE au sein de ces lignées est peu décrite. Une analyse de la diversité des souches et des TALE a été menée sur une collection de 144 souches Xcf-Xpp via la mise en place d’une approche MLVA. Ici, nous avons montré que les souches GL1 présentent la plus grande diversité de souches et de TALE et que les souches GL2 ne sont pas endémiques de La Réunion comme supposé auparavant. Nos résultats fournissent une description précise de la diversité des souches Xcf-Xpp présentes dans les différents bassins de production du haricot au moment de la constitution de la collection. Ils permettent de conclure quant aux souches et aux TALE les plus présents dans ces bassins de productions. Le développement de l'analyse MLVA sur ces souches permettra d'effectuer des suivis épidémiologiques sur Xcf-Xpp ce qui permettra d'identifier les différentes voies d'introduction des souches et de mettre en place une stratégie de lutte. L'analyse des TALEs permettra quant à elle de déterminer quels sont les profils TALEs majoritairement présents et d'identifier des sources de résistance face à ces effecteurs.