Comparison of different spatial strategies for sampling a core collection of natural populations of fodder crops | Comparaison de differentes strategies spatiales d'echantillonnage d'une core collection parmi des populations naturelles d'especes fourrageres
1998
Balfourier, F. (Institut National de la Recherche Agronomique, Clermont Ferrand (France). Centre de Clermont Ferrand Theix, Station d'Amelioration des Plantes) | Charmet, G. | Prosperi, J.M. | Goulard, M. | Monestiez, P.
French. Sept strategies d'echantillonnage d'une core collection sont comparees sur deux collections de populations naturelles d'especes fourrageres (Lolium perenne et Medicago truncatula) prealablement evaluees pour des caracteristiques agronomiques. Les cinq premieres strategies consistent en des tirages aleatoires simples ou stratifies selon un seul niveau de classification des populations: (i) aleatoire simple (strategie Random); (ii) stratifie selon une classification basee sur les caracteristiques agronomiques (strategie Stratagro); (iii) stratifie selon la region ou le pays d'origine (strategie Stratreg); (iv) stratifie selon les caracteristiques agronomiques avec contrainte de contiguite geographique (strategie Straconti); (v) stratifie selon les structures spatiales des populations (strategie Stratspa), determinees par les methodes de la geostatistique. Il s'agit de methodes statistiques adaptees a l'analyse de donnees spatiales et a la mise en evidence de structure ou distributions spatiales non aleatoires. Enfin, deux autres strategies deterministes sont testees, elles sont basees sur un critere de maximisation de distance entre populations, ce critere etant applique aux donnces agronomiques de base des populations (strategie PCSS) et a leurs composantes spatiales (strategie SPPCSS). Les differentes strategies sont comparees selon deux criteres: leur capacite a capturer la diversite phenotypique contenue dans la collection de depart, mesuree par un indice de Shannon, et leur aptitude a restituer la structuration spatiale de la collection globale, mesuree par une distance entre cartes etablies pour des caracteres agronomiques. Les comparaisons montrent que, chez les deux especes, les strategies tenant compte des structures spatiales (Stratspa et SPPCSS) donnent les meilleurs resultats, aussi bien pour l'indice de diversite globale que pour la representativite des cartes
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