Interactions between microbial processes and geochemical transformations under anaerobic conditions: a review | Interactions entre processus microbiens et transformations géochimiques en condition d'anaérobiose: une bibliographie

French. L'existence de conditions anaérobies dans un sol peut avoir des effets environnementaux néfastes sur ce sol, ainsi que sur la zone non saturée profonde, l'aquifère et l'atmosphère. Ces effets incluent la mobilisation de métaux et l'émission de gaz à effet de serre. Ils résultent de processus microbiens interagissant étroitement avec les transformations géochimiques. Les principales voies du catabolisme microbien anaérobie sont des respirations, les fermentations, l'acétogénèse et la méthanogénèse. D'un côté, les caractéristiques géochimiques de la solution affectent les activités microbiennes au travers de la disponibilité en substrats, de régulations thermodynamiques, et d'inhibitions. D'un autre côté, les activités microbiennes affectent le pH de la solution du sol, son niveau d'oxydoréduction, la complexation des métaux avec des acides gras volatils, et les réactions d'adsorption/désorption et de dissolution/précipitation au niveau des phases solides. Certaines particules solides (calcite, oxydes et oxyhydroxydes métalliques) peuvent toutefois tamponner partiellement l'évolution de la solution et les transformations abiotiques peuvent régénérer partiellement des accepteurs terminaux d'électrons utilisés par les micro-organismes. Peu de modèles couplent processus microbiens et transformations géochimiques, la plupart d'entre eux ont été proposés initialement pour décrire le fonctionnement des bio-digesteurs anaérobies. Les transformations géochimiques sont alors restreintes aux réactions acido-basiques, et les réactions entre solides et solution sont ignorées. De nombreuses problématiques environnementales nécessitent le développement de modèles biogéochimiques, qui doivent distinguer les transformations microbiennes des transformations abiotiques en raison de leur caractère cinétique et des facteurs spécifiques les affectant