Phylogenetic analysis and gene linkage of ArgR/AhrC orthologs revealed groups of syntenie in Gram-positive bacteria | Recherche d'orthologues d'ArgR/AhrC dans le génome de bactéries à Gram positif Mise en évidence de groupes de synténie
2002
Bringel, F. ((Université Strasbourg 1 (France). Laboratoire de Microbiologie et de Génétique)) | Nicoloff, H. | Arsene-Ploetze, F. | Hubert, J.C.
French. La régulation arginine-dépendante des gènes impliqués dans le métabolisme de l'arginine est coordonnée au niveau de la transcription par un répresseur ArgR (aussi dénommé AhrC). Nous avons recherché des orthologues de ce répresseur dans les génomes complets ou en cours de séquençage d'organismes apparentés aux bactéries à Gram positif en utilisant comme références ArgR de Lactobacillus plantarum et AhrC de Bacillus subtilis. De deux à quatre copies de ces gènes sont présentes chez Staphylococcus aureus, Lactococcus lactis, Enterococcus faecalis ainsi que chez différentes espèces de streptocoques. Un arbre phylogénétique de 41 protéines ArgR-like mis en parallèle avec le contexte génétique des gènes codant ces protéines, a montré trois groupes de synténie. Le gène argR est lié à recN (15 cas)à des gènes du catabolisme de l'arginine (7 cas)à des gènes de biosynthèse de l'arginine (3 cas) et à aucun gène en particulier (autres cas). Les deux premiers groupes de synténie sont présents chez Lc. Lactis, S. aureus et chez les Streptocoques (S. thermophilus, S. equi, S. mutans, S. pyogènes et S. pneumoniae). Cette organisation conservée et les homologies des protéines ArgR au sein d'un même groupe de synténie, suggèrent que ces diverses copies jouent un rôle différent dans les bactéries
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