Chromosome in situ suppression hybridisation to B-A translocation lines for physical mapping in maize [Zea mays L.]
2005
Sadder, M.T. (Jordan Univ., Amman. Dept. of Horticulture and Crop Science) | Henrich, J. (Lion Bioscience AG, Heidelberg (Germany)) | Ponelies, N. (Hohenheim Univ., Stuttgart (Germany, F.R.). Inst. of Plant Breeding, Seed Science and Population Genetics) | Weber, G. (Hohenheim Univ., Stuttgart (Germany, F.R.). Inst. of Plant Breeding, Seed Science and Population Genetics)
English. Fluorescence in situ hybridization (FISH) is a powerful tool for physical localization of molecular markers and genes on chromosomes. Subsequently, physical mapping allows a better understanding of recombination events and genome structure and function. Using either mitotic metaphase or meiotic pachytene chromosomes implies an unambiguous identification of individual chromosomes with specifically targeted cytogenetic markers. B-A translocation lines were used as an alternative source of chromosomes that show unique inherited morphological characteristics. Molecular markers linked to quantitative trait loci for resistance against sugarcane borer were used. Using chromosome in situ suppression hybridization, a form of FISH, about 35 kb cosmid clones with homologous sequences to the markers umc105a, csu145a and csu93a were hybridized to mitotic metaphase chromosome spreads of maize B-A translocation lines. The cosmids were physically localized on chromosome arms of chromosome 9 using the B-A translocation lines similar to the previously reported positions using normal lines. The marker umc105a was localized on the short arm near the telomere. Molecular markers csu145a and csu93a were positioned in the telomeric region of the long arm of chromosome 9. The results demonstrate a new valuable use of B-A translocation lines with FISH that opens a new frontier for plant physical mapping
Show more [+] Less [-]Italian. [L'ibridazione fluorescente in situ (FISH) è uno strumento efficace per la localizzazione fisica dei marcatori molecolari e dei geni sui cromosomi. La mappatura fisica consente poi una maggiore comprensione degli eventi di ricombinazione e della struttura e funzione del genoma. L'utilizzazione sia dei cromosomi in metafase mitotica, sia dei cromosomi al pachitene della meiosi consente un'identificazione certa di singoli cromosomi con marcatori citogenetici specificamente mirati. Sono state utilizzate linee con traslocazione B-A come fonte alternativa di cromosomi che presentano caratteristiche cromosomiche ereditate uniche. Sono stati impiegati marcatori molecolari legati a loci di caratteri quantitativi per la resistenza nei confronti della minatrice della canna da zucchero. Utilizzando l'ibridazione cromosomica in situ con soppressione, che è una forma di FISH, cloni cosmidici di circa 35 kb con sequenze omologhe ai marcatori umc105a, csu145a e csu93a sono stati ibridati con schiacciamenti di cromosomi in metafase mitotica di linee di mais con traslocazione B-A. I cosmidi sono stati localizzati fisicamente sui bracci del cromosoma 9 utilizzando le linee con traslocazione B-A simili alle posizioni riportate precedentemente con l'utilizzazione di linee normali. Il marcatore umc105a è stato localizzato sul braccio corto vicino al telomero. I marcatori csu145a e csu93a sono stati localizzati nella regione telomerica del braccio lungo del cromosoma 9. I risultati evidenziano un nuovo significativo impiego delle linee con traslocazione B-A con la FISH, che apre una nuova frontiera per la mappatura fisica nelle piante.]
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